低温厌氧颗粒污泥中微生物菌株的生物信息学分析环境工程专业论文.docxVIP

摘要摘要 摘要 摘要 微生物是废水处理的主要功能生物，在废水处理系统中多种微生物共存且相互 作用。充分认识其中的微生物学原理能为改进处理工艺、提高处理效率提供依据。 基于培养和分离纯化的传统技术已经无法满足研究者对环境微生物进行快速、准确 的分析与鉴定的要求。 随着人类基因组计划(HGP)的实施，生物信息学产生并成为2l世纪自然科学的 核心领域，通过生物信息学的研究平台，能够实时在线检索丰富的微生物资源，可 以共享环境微生物基因组信息。利用16S rDNA／rKNA序列分析技术，研究者可以在 不对微生物进行分离培养的情况下对其进行研究，对特定环境中的微生物进行分析 鉴定，并对微生物群落的结构和功能进行研究，结果准确、快速。 本课题依靠传统分离培养方法获取了低温厌氧颗粒污泥中微生物的形态及生理 生化特性，通过16S rDNA序列测定的方法获取了6菌株的16S rDNA序列。并运用 新兴的生物信息学手段对6菌株的16S rDNA序列进行分析。 使用BioEdit软件分析序列的碱基分布、G屺含量及通过寻找开放阅读框将核酸 序列翻译为对应的氨基酸序列。使用ClustalX软件对6菌株的16S rDNA序列进行多 序列比对，在比对结果的基础上使用MEGA软件对6菌株16S rDNA序列进行同源 性分析并构建系统发育树，分析未知菌种与其他菌种的亲缘关系，进一步了解生物 的进化关系。 关键词低温厌氧；颗粒污泥：微生物菌株；生物信息学；16S rDNA：序列分析； 系统发育树 河北科技大学硕士学位论文Abstract 河北科技大学硕士学位论文 Abstract Microorganisms al e the key organisms in the wastewater biological treatment systems．Within the wastewater treatment systems，a variety of microorganisms was coexisted and interacted．So，studying the microbial communities within these systems is very important for technique improvement and efficiency enhancement．Traditional techniques which is based on culture and separation could not satisfy environmental more directly and more exactly nowaday． With Human Oenome Project(HGP)being brought intoforce，bioinfonnatics appeared and became the core areas of natural science in 2 1 century．By means of the bioinformatics research platform，a wealth of microbial resources Can bc researched real-time ovaine and genome of environmental microbiology Can be shared．Using molecular approaches based on 1 6S rRNA or rDNA sequence comparison，researchers can study microbes without culture and separation．And the results were gained fast and accurately． This test obtained the form，physiological and biochemical characteristics of low-temperature anaerobic sludge microorganisms relied on the traditional metehod of isolation and culture．By measuring 1 6S rDNA sequences，six sequences were gained． Application of emerging bioinformatics tools，1 6S rDNA sequences of 6 strains were beinganalysised． Using Bioedit soRware，base co