利用SSR标记分析茄镰孢豌豆专化型的遗传多样性.PDFVIP

生物多样性 2012, 20 (6): 693–702 Doi: 10.3724/SP.J.1003.2012.10062 Biodiversity Science http: // 利用SSR标记分析茄镰孢豌豆专化型的遗传多样性 1,2 2 1 1 1* 向 妮 肖炎农 段灿星 王晓鸣 朱振东 1 (中国农业科学院作物科学研究所, 农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程, 北京 100081) 2 (华中农业大学植物科技学院, 武汉 430070) 摘要: 由茄镰孢豌豆专化型(Fusarium solani f. sp. pisi, Fsp)引起的根腐病是豌豆(Pisum sativum)最重要的病害之 一。研究不同地理来源Fsp 的遗传多样性, 对了解该菌的遗传背景及防治病害具有重要意义。本研究从血红丛赤壳 交配群VI(Nectria haematococca MPVI)全基因组序列中筛选SSR位点, 选取107个SSR位点设计引物, 获得24对多 态性引物。用24对多态性引物对不同地理来源的96个Fsp分离物进行遗传多样性分析, 结果表明, 24对引物共扩增 出132个等位基因, 变异范围为3–15, 平均为5.5 。基因多样性指数范围为0.4855–0.8264, 平均为0.7038 。供试的96 个Fsp分离物可分为93个基因型。聚类分析表明, 在相似性系数为0.8时, 96个Fsp分离物被划分为10个组群。Fsp分 离物的地理来源或致病性与SSR聚类结果无关。分子方差分析(AMOVA)结果表明, Fsp遗传变异主要存在于群体 内, 地理条件和生态区环境对Fsp遗传分化有显著影响。 关键词: 豌豆根腐病, 豌豆, Fusarium solani f. sp. pisi, SSR标记, 遗传变异 Genetic diversity in Fusarium solani f. sp. pisi based on SSR markers 1, 2 2 1 1 1* Ni Xiang , Yannong Xiao , Canxing Duan , Xiaoming Wang , Zhendong Zhu 1 Institute of Crop Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences/The National Key Facility for Crop Gene Re- sources and Genetic Improvement, Beijing 100081 2 College of Plant Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070 Abstract: Pea root rot, caused by Fusarium solani f. sp. pisi (Fsp), is one of the most important diseases on pea (Pisum sativum). Assessing the genetic diversity of the pathogen isolates from different geogr