生物信息学导论与方法课程教学大纲-上海交通大学生物医学工程学院.PDF

生物信息学导论与方法课程教学大纲 课程基本信息（Course Information ） *学时 课程代码 *学分 （Credit 32 2 （Course Code ） （Credits ） Hours） （中文）生物信息学导论与方法 *课程名称 （Course Name ） （英文）Introduction to Bioinformatics 课程性质 (Course Type) 授课对象 本科三/ 四年级 （Audience ） 授课语言 (Language of 双语 （汉语+英语） Instruction) *开课院系 生物医学工程学院 （School ） 先修课程 （Prerequisite） 授课教师 课程网址 林关宁 /teaching.html （Instructor） (Course Webpage) （中文300-500 字，含课程性质、主要教学内容、课程教学目标等） 生物信息学是一门新兴的生命科学与计算科学的前沿交叉学科。本课程讲授生 物信息学主要概念和基本计算技术。内容主要包括基因、蛋白序列比对，数据库搜 索，马可夫模型，新一代测序介绍，突变的功能预测，转录组测序与分析，非编码 RNA 和表观遗传，人工智能与机器学习基础，本体论和分子通路，以及 R 编程语言 *课程简介 入门和实验上机数据处理与分析等。重点放在生物信息学的计算方法及其运用方面， （Description） 包括生物问题的制定，算法的设计，软件开发的置信度评估等。通过本课程的介绍， 使学生系统地掌握生物信息学的基本理论、基本知识，掌握生物信息学的基本技 术，培养学生如何充分使用交叉学科的知识与技术，训练学生分析问题和解决问 题的能力及实际动手数据处理和分析能力。通过本课程的理论介绍和实际数据上机 操作，将让学生掌握如何应用生物信息学和计算科学手段解决生命和医学，特别在 大数据和精准医疗等领域的科学问题。 （英文300-500 字） The course will introduce the fundamental concepts and basic computational techniques for mainstream bioinformatics problems. The course covers sequence *课程简介 alignment, sequence database search, Markov model and multiple sequence alignment, （Description） functional prediction of genetic variants, next generation sequencing, noncoding RNA and