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上海海洋大学硕士学位论文
上海海洋大学硕士学位论文
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前肠组织
1)位于 8 号连锁群的 QTL 区间内的微卫星标记所连锁的基因与斑马鱼位于 13 号染色体的富含亮氨酸重复蛋白 mRNA(leucine-rich repeat-containing protein mRNA)具有高度同源性。该 QTL 区间位置与肝脏组织 LG8 中的区间位置相 同。
2)位于 10 号连锁群的 QTL 区间内的微卫星标记所连锁的序列与斑马鱼位于 1 号染色体的某一序列具有高度同源性,并且很重要的是,该位置与斑马鱼 SOD mRNA 位置非常接近。
3)位于 14 号连锁群的 QTL 区间内的微卫星标记所连锁的基因与斑马鱼位于 18
号染色体的跨膜蛋白 mRNA(transmembrane protein mRNA )具有高度同源性。 4)位于 36 号连锁群的 2 个 QTL 区间内的微卫星标记所连锁的基因与斑马鱼位于
17 号染色体的似细胞分裂周期蛋白 5 mRNA 及溶酶体相关跨膜蛋白 mRNA
( cell division cycle 5-like protein mRNA 和 lysosomal-associated protein transmembrane mRNA )分别具有高度同源性。
后肠组织
(1)位于 6 号连锁群的 5 个 QTL 区间内的微卫星标记所连锁的基因分别与 斑马鱼位于 7 号染色体的 CCAAT 增强子结合蛋白,RNA 结合蛋白 MEX3B,跨 膜蛋白 88,NEDD4 结合蛋白 1 和轴突蛋白 2β mRNA (CCAAT/enhancer binding protein, RNA-binding protein MEX3B, transmembrane protein 88, NEDD4-binding protein 1 和 neurexin-2-beta mRNAs)分别具有高度同源性。
(2)位于 10 号连锁群的 QTL 区间内的微卫星标记所连锁的基因与斑马鱼位 于 1 号染色体的 CACCC 盒结合蛋白 mRNA(CACCC-box-binding protein mRNA) 具有高度同源性。
因此,从上面结果可以看出这些 QTL 区间极有可能是调控 SOD 表达的主效
区间。这些数据也进一步支持了基因组在进一步研究生物发育方面以及作为分子 选育方面所体现的价值。
关键词:镜鲤,超氧化物歧化酶,微卫星标记,遗传连锁图谱,数量性状定位
Studies on Quantitative Trait Loci related to Superoxide Dismutase in Mirror Carp (Cyprinus carpio L.)
ABSTRACT
Mirror carp, a variety of common carp, accounts for an increasingly larger proportion of production due to its faster growth, better disease resistance, higher meat conversion rate and near absence of scales on the body surface. In our study, the F1 progenies that came from the parents selected randomly with the differences in performance traits from different family of mirror carp were used as mapping panel. With 992 microsatellite polymorphic markers, 192 individuals were genetyped, and the results of linkage maps, QTLs and the Blastn with zebrafish genome were showed below:
Phenotypic values of SOD traits in the F1 progeny at 400 days post-hatch were measured. The average SOD values of the 190 F1 individuals were 179.56±5.49, 27.51±0.81 and 50.61±1.31 U in liver, anterior intestine and posterio
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