课件：酶学基础.ppt

* 孙利芹2011 酶的亲核催化机制示例 孙利芹2011 5、微环境效应 Define 微环境是指酶的活性中心上的催化基团所处的一种特殊的疏水反应环境。 由于酶分子活性中心的催化基团处于特殊的疏水反应环境，影响酶与底物的结合，并影响催化基团的解离，使反应加速进行，这种作用称为微环境效应。 许多有机化学反应会受到其溶剂环境的影响,如叠氮盐与硝基氟苯的反应： N3- + F NO2 F- + N3 NO2 在二甲亚砜中进行时的速度比在水中进行时快12000倍 孙利芹2011 微环境效应的作用 孙利芹2011 溶菌酶催化的微环境效应 孙利芹2011 核酶的自我剪接机制 自我剪接的核酸类酶通过酶RNA或其辅助因子上所含的嘌呤-OH攻击分子本身的剪接点.催化自我剪接反应 Ⅰ型IVS(与四膜虫26SrRNA前体的IVS结构相似的间隔序列) Ⅱ型IVS剪接酶(与细胞核mRNA的IVS结构相似的间隔序列,在植物和低等真核生物的细胞器基因组中发现) 孙利芹2011 第一步: GTP的3′-OH作用左边外显子和内含子交界处的磷酸二酯键，本身结合到内含子的5′末端，被切下的5′外显子仍保持在底物位点上，并未游离。 第二步:内含子的G414（即3′交界序列