基于基因组学天然产物研究.PDFVIP

·１２４· 济宁医学院学报２０１８年４月第４１卷第２期　ＪＪｉｎｉｎｇＭｅｄＵｎｉｖ，Ａｐｒｉｌ２０１８，Ｖｏｌ４１，Ｎｏ．２ ＤＯＩ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１０００９７６０．２０１８．０２．０１１ ·博士论坛 · 基于基因组学的天然产物研究 王　涛 （济宁医学院生物科学学院，日照２７６８２６） 　　摘　要　天然产物由于其结构及生物活性的多样性，一直是药物研发的一个重要来源。但是在过去的一段 时间里，由于高通量筛选技术的制约，导致天然产物研究进展较为缓慢。近年来ＤＮＡ测序技术的不断进步，从 分子水平上对微生物次级代谢的研究，揭示了大自然在生产天然产物方面的非凡能力，这给新药研发提供了新 的研究方向。基于基因组学的天然产物发现是一种理性的、高效的及建立在测序技术上的发掘新化合物的方 法。而生物信息学和合成生物学技术的蓬勃发展则为天然产物的探索与结构改造提供了便利的技术手段。鉴 于此，本文将重点阐述基于基因组学的天然产物发现，包括其关键的步骤，相关的技术及涉及的成功应用。 关键词　天然产物；新药发掘；基因组学；组合生物合成 中图分类号：Ｑ８１２　　文献标识码：Ａ　　文章编号：１０００９７６０（２０１８）０４１２４０８ Ｓｔｕｄｙｏｎｔｈｅｇｅｎｏｍｉｃｄｒｉｖｅｎｄｉｓｃｏｖｅｒｙｏｆｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｎａｔｕｒａｌｐｒｏｄｕｃｔｓ ＷＡＮＧＴａｏ （ＳｃｈｏｏｌｏｆＢｉｏｌｏｇｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＪｉｎｉｎｇＭｅｄｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｒｉｚｈａｏ２７６８２６，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｎａｔｕｒａｌｐｒｏｄｕｃｔｓｈａｖｅｂｅｅｎｔｈｅｍａｉｎａｎｄｒｉｃｈｓｏｕｒｃｅｏｆｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓｆｏｒｎｏｖｅｌｄｒｕｇｄｉｓｃｏｖｅｒｙ ｏｗｎｉｎｇｔｏｔｈｅｄｉｖｅｒｓｅｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓａｎｄｂｉｏａｃｔｉｖｉｔｉｅｓ．Ｈｏｗｅｖｅｒ，ｔｈｅｔｅｃｈｎｉｃａｌｂａｒｒｉｅｒｓｔｏｓｃｒｅｅｎｉｎｇｎａｔｕｒａｌｐｒｏｄ ｕｃｔｓｉｎｈｉｇｈｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔａｓｓａｙｓｈａｖｅｍａｄｅｔｈｅｎａｔｕｒａｌｐｒｏｄｕｃｔｒｅｓｅａｒｃｈｓｌｏｗｄｏｗｎｉｎｔｈｅｐａｓｔｔｗｏｄｅｃａｄｅｓ． Ｒｅｃｅｎｔｌｙ，ｗｉｔｈｔｈｅｒａｐｉｄｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆＤＮＡｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ，ｒｅｓｅａｒｃｈｐｒｏｇｒｅｓｓｅｓｏｎｍｉｃｒｏｂｉａｌｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓｈａｖｅ ｒｅｖｅａｌｓｔｈｅｇｒｅａｔｐｏｔｅｎｔｉａｌｏｆｎａｔｕｒｅｔｏｐｒｏｄｕｃｅｎａｔｕｒａｌｐｒｏｄｕｃｔｓ，ｗｈｉｃｈｔｈｒｅｗｎｅｗｉｎｓｉｇｈｔｓｉｎｔｏｎｏｖｅｌｄｒｕｇ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｔｔｈｅｍｏｌｅｃｕｌａｒｌｅｖｅｌ．Ａｍｏｎｇｔｈｅｍ，ｇｅｎｏｍｉｃｄｒｉｖｅｎｄｒｕｇｄｉｓｃｏｖｅｒｙｉｓａｎｅｆｆｉｃｉｅｎｔａｎｄｒａｔｉｏｎａｌ ｓｔｒａｔｅｇｙｔｏｄｉｓｃｏｖｅｒｎｏｖｅｌｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓｂａｓｅｄｏｎＤＮＡｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ．Ｔｈｅｔｈｒｉｖｉｎｇｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎｄｓｙｎｔｈｅｔｉｃｂｉ ｏｌｏｇｙｗｉｌｌｐｒｏｖｉｄｅａｆａｉｒｌｙａｃｃｅｓｓｉｂｌｅｗａｙｏｆｅｘｐｌｏｒｉｎｇａｎｄｍｏｄｉｆｙｉｎｇｎａｔｕｒａｌｐｒｏｄｕｃｔｓ．Ｉｎｔｈｉｓｒｅｖｉｅｗ，ｉｔｉｓｆｏ ｃｕｓｅｄｏｎｔｈｅｐｒｏｃｅｓｓｏｆｇｅｎｏｍｉｃｄｒｉｖｅｎｄｒｕｇｄｉｓｃｏｖｅｒｙ，ｉｎｃｌｕｄｉｎｇｔｈｅｋｅｙｓｔｅｐｓａｎｄｔｅｃｈｎｉｃａｌａｐｐｒｏａｃｈｅｓ．Ｉｎ ａｄｄｉｔｉｏｎ，ｔｈｅｓｕｃｃｅｓｓｆｕｌｅｘａｍｐｌｅｓａｒｅａｌｓｏｈｉｇｈｌｉｇｈｔｅｄ． Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：Ｎａｔｕｒａｌｐｒｏｄｕｃｔ；Ｄｒｕｇｄｉｓｃｏｖｅｒｙ；Ｇｅｎｏｍｉｃｓ；Ｃｏｍｂｉｎａｔｏｒｉａｌｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ 　　先导化合物的发掘与鉴定是新药研发过程中 大量的药效团结构和高度的立体选择性，导致了很 一项耗时费力、极具挑战性的科研活动