棉花HKT基因家族的全基因组分析探究.pdfVIP

江苏农业学报(JiangsuJ.of Agr.Sci.),2017,33(5):975~981 http:/ / 975 郭 琪,徐珍珍,黄 芳,等. 棉花HKT基因家族的全基因组分析[J].江苏农业学报,2017,33(5):975-981. doi:10.3969/ j.issn.1000-4440.2017.05.003 棉花HKT基因家族的全基因组分析 1 1 2 1 1 1 郭 琪 , 徐珍珍 , 黄 芳 , 徐 鹏 , 张香桂 , 沈新莲 (1.江苏省农业科学院经济作物研究所/ 农业部长江下游棉花和油菜重点实验室,江苏 南京 210014; 2.南通大学生命科学 院,江苏 南通 226019) ＋ ＋ ＋ 摘要: HKT(high-affinity K transporter)转运蛋白在调节植物体内K / Na 转运,参与逆境胁迫调控中发挥重要 作用。 本研究利用生物信息学方法,系统分析了棉花HKT基因家族的分类、系统进化树、组织表达以及HKT蛋白的 亚细胞定位、跨膜结构、基序情况等。 结果显示,棉花中共有8个HKT基因家族成员,编码的8个HKT蛋白都定位到 了质膜上,具有7~10个不等的跨膜数;系统进化树分析结果表明,棉花8个HKT基因家族成员大致分为2个小组,在 进化树上分支比较近的HKT基因家族成员编码的HKT蛋白具有完全相同或者比较类似的motif类型和跨膜数;组织 表达分析发现,克劳茨基棉仅有GrHKT1;1和GrHKT1;22个成员在200mmol/ L的NaCl溶液处理0h、3h、12h、72h和 144 h后具有不同程度的响应。 关键词: HKT基因家族; 生物信息; 棉花 中图分类号: S562 文献标识码: A 文章编号: 1000-4440(2017)05-0975-07 Genome-wideanalysisofhigh-affinitypotassiumtransportergenefamilyin cotton 1 1 2 1 1 1 GUO Qi , XU Zhen-zhen , HUANG Fang , XU Peng , ZHANG Xiang-gui , SHEN Xin-lian (1.Instituteof Industrial Crops,JiangsuAcademy of AgriculturalSciences/ KeyLaboratory of CottonandRapeseed,Ministry of Agriculture,P.R.China,Nan- jing 210014,China; 2.School of Life Science,Nantong University,Nantong 226019,China) ＋ ＋ Abstract: High-affinity potassium transporter(HKT) is involved in K / Na transportation,and plays an important role in adaptation to abiotic stress.The classification of HKTgenefamily,HKT protein