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2014科学数据大会 ·北京
以化合物标识为基础的化学数
据集成与应用
赵月红
中国科学院过程工程研究所
2014/2/28 ,北京
内容概要
I. 基于化合物标识的化学数据集成
II. 数据集成应用—化学主题数据库
III. 下一步工作
IV. 几点思考
整合的科学基础
分析化学与光谱学 环境化学
化学物质分析方法数据库 化学物质毒性数据库
红外光谱数据库 化合品安全特性数据库
质谱谱图数据库 毒性化合物数据库
C-13 NMR波谱数据库 化学品安全和处置数据库
晶体结构数据库 化合物 有机化学
应用化学 标识 化学结构数据库
化学配方数据库 化学反应数据库
化工产品数据库
精细化工产品数据库 物理化学
稀土萃取数据库 物性及热化学数据库
稀土物性数据库
天然产物与药物化学 相变数据库
药物与天然产物数据库 聚合物溶液相平衡数据库
生物活性数据库 非电解质体系汽液
化合物活性数据库 相平衡数据库
中药与有效成分数据库 离子簇热化学数据库
晶体结构数据库
整合的技术措施
†
化合物唯一标识 : CAS RN
InChIKey
SRN
化合物标识-成员库化合物ID映射表†
字段名 定义 数据类型 建立索引 备注
CAS RN CAS登录号 varchar(10) Y 需进行校验
InChIKey InChIKey码 varchar(27) 程序生成
SRN 化学参考库登录号 Long(10) Y 化学参考库登录获取
id 数据库内部化合物编码 varchar(50) Y/N 根据数据库实际确定
†化学主题数据库化合物标识-化合物ID索引规范
整合的技术措施
†
数据交换 : Web service技术
生成XML片段
语法格式: http://url/service?query
†
数据内
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