鱼类DNA条形码技术的应用进展.docVIP

鱼类DNA条形码技术的应用进展 陈信忠郭书林龚艳清 厦门出入境检验检疫局 关键词： 鱼类;DNA条形码;物种鉴定;鱼类产品标识;进展; 作者简介：陈信忠（1964-），男，研究员，博士;研究方向:海洋生物 学.E-mail:chcnxz@xmciq. gov. cn. 收稿日期:2016-12-26 基金：福建省农业引导性（重点）项目（2015N0015） Progress on Application of Fish DNA Barcoding:a Review CHEN Xinzhong GUO Shulin GONG Yanqing Xiamen Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau; Keyword： fish; DNA barcoding; species identification; labeling of fish product; progress; Received： 2016-12-26 基于DNA序列进行物种鉴定的DNA条形码技术自2003年问世以来，经过十儿年 的快速发展，不仅在各种动植物的物种鉴定方面取得巨大成就，而且在动植物 区系、生态和物种保护、生物安全、食品安全等方面得到越来越多的应用，并取 得一系列成果。鱼类是最具多样性的脊椎动物，全球预计有多达40000种鱼类 Hlo由于在发展过程中具有高度的多样性，传统的鱼类物种鉴定方法存在很多 问题。DNA条形码在角类物种鉴定中最早获得应用。2005年开始实施的角类生命 条形码计划(FISH-BOL)是一项国际合作计划，通过采用经过权威的分类鉴定 的标木，研究鱼类线粒体细胞色素氧化酶I亚基(COI )基因，以电子数据库 形式构建含有DM条形码、图像和地理坐标的全球鱼类参考标准数据库，应用 DNA条形码简化鱼类识别工作，重点解决传统形态学方法无法鉴别的难题。鱼类 生命条形码计划述特别关注市场上物种替代和商业渔业管理等社会问题図。鱼 类DNA条形码在濒危物种保护，防止外来物种入侵等方面也得到越来越多的应 用。不过，该技术在鱼类近缘物种以及亚种水平的鉴定方面还有一定的局限性。 我国的鱼类DNA条形码研究相对较少，目前主要在少数鱼类鉴别以及小流域鱼 类区系方面取得一些进展，在其他领域的应用还很少，尚未建立系统、完善的数 据库。但我国是水产养殖和渔业大国，也是观赏鱼主要生产国和出口国。我国每 年引进大量的鱼类物种进行人工繁育和种质资源改良。另一方面，我国有众多不 同的水域环境和鱼类区系。因此，应用最新的鱼类鉴別和分类技术，对我国水产 养殖业的健康发展以及鱼类资源和生态环境的保护等方面均具有重要指导意义。 1鱼类DNA条形码的应用 DNA条形码在鱼类分类中的应用 龟类DNA条形码最重要的作用就是对角类进行准确鉴别，弥补传统形态学鉴定 方法的不足，发现或纠正传统分类学中隐含的错误，明确全球主要水域的鱼类 的种类、发展历史以及与生态环境的相互作用，为有效利用鱼类资源，保护鱼类 多样性提供科学依据。DNA条形码技术与传统形态学分类方法相结合，不仅可以 快速、准确的对物种进行鉴定和分类，还可能发现许多潜在的物种。以DNA条形 码为主要技术的龟类生命条形码系统为龟类学学科理解各种龟类的自然史和生 态相互作用提供了一个有力的工具。 理想的DNA条形码首先要求具备适宜的序列变异水平，可以区分不同物种而且 种内变异较小;其次，要求变异区域两端具有高度保守的序列，可以设计通用的 扩增引物;第三，还要求较短的扩增序列。根据已有研究，CO I基因是鱼类分类 与鉴别的理想DNA条形码固。鱼类生命条形码计划己对己知的31 000种鱼类中 的8000种鱼类的CO I基因条形码进行了测定，这些鱼类涵盖了全球绝大多数重 要的商业物种。现有的研究结果表明，应用CO I条形码可以有效区分约98%的海 洋鱼类和93%的淡水鱼类丄11。除了 CO I基因，其他可用于鱼类DNA条形码的基 因包括细胞色素B (Cyt B)、NADH脱氢酶亚单位2 (ND2)和兰尼定受体3 (RYR3) 等回。但由于CO I基因比其他基因更适合作为鱼类鉴别的基因条形码，可以鉴 别绝大多数鱼类，因此至今针对其他基因条形码的研究还很少。 DNA条形码在鱼类区系研究中的应用 DNA条形码技术对构建不同国家和地区的江河湖海等流域的鱼类区系数据库具 有重要价值。全球鱼类种群和数量最丰富的地区包括南美洲、屮：?洲和亚洲等地区。 近年来南美地区龟类区系的研究报告相对较多。Decru等固比较了 DNA条形码 和传统形态学鉴定技术鉴定刚果东北流域的鱼类区系的差异。比较了 206种通过 形态学识别的物种及其821例CO I序列。结果发现有26. 1%的样品种内遗传距离 小于1,表明依据形态学分类