生物信息学数据库大全.doc

综合数据库★ INSD,国际核酸序列数据库（International Nucleotide Sequence Databank）。由日本的DDBJ、欧洲的EMBL和美国的GenBank三家各自建立和共同维护。★ EMBL库，欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA 序列库。? http://www.ebi.ac.uk/embl.html?★ GenBank ，美国国家生物技术信息中心 （NCBI）所维护的供公众自由读取的、带注释的DNA序列的总数据库。 /Web/Genbank/?★ DNA Databank of Japan (DDBJ) ，日本核酸数据库。? http://www.ddbj.nig.ac.jp/?★ GSDB是由美国国家基因组资源中心（NCGR）维护的DNA序列关系数据库（Genome Sequence DataBase）。? /gsdb/?★ TIGR DATAbase,是世界上最大的cDNA数据库，还有大量的EST序列和人类基因索引（HGI）。? /tdb/hcd/overview.html?DNA序列数据库包括与DNA的复制、转录、修复等有密切关系的蛋白质因子。★BioSino是中国自主开发的核酸序列公共数据库。 /?★CUTG,MM子使用频度表。 http://www.dna.affrc.go.jp/~nakamura/CUTG.html? http://www.kazusa.or.jp/codon/? http://www.dna.affrc.go.jp/~nakamura/CUTG.html?★EPD,真核生物启动子数据库（Eukaryotic Promotor Database）。 http://www.epd.isb-sib.ch/?★TRANSFAC,真核生物基因表达调控因子的数据库。 http://transfac.gbf.de/TRANSFAC?★ TRRD.真核生物基因组转录调控区数据库。 http://www.mgs.bionet.nsc.ru/mgs/dbases/trrd4/?★OOTFD,转录因子和基因表达数据库。 /?★RepBase,真核生物DNA中重复序列数据库。 /~server/repbase.html?★ MicroSatellite,微卫星重复序列数据库。 /gopher-menus/MicroSatelliteDatabase.html?★ALU数据库是人及其他灵长类代表性的Alu重复片段。 (/pub/jmc/alu/)?★ Simple Repeats,简单重复序列库。 ?★COMPEL,复合元件数据库。 ftp://ftp.gbf-braunschweig.de(/pub/compel/)?★MPDB,分子探针数据库。 http://www.biotech.ist.unige.it/interlab/mpdb.html?★HvrBase,灵长类mtDNA调控区序列库，主要是人的HVI和HVII两个高变异区的序列。 http://monolith.eva.mpg.de/hvrbase/?★PlantCARE,植物顺式作用(cis-acting)调控因子数据库。 http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCare/?★PLACE是从文献中搜集的植物顺式作用调控元件DNA模体的数据库,只涉及维管植物。 http://www.dna.affrc.go.jp/htdocs/PLACE/? ftp://ftp.dna.affrc.go.jp(/pub/dna_place/place.seq)★Mendel数据库,搜集植物STS和EST序列。? http://jiio6.jic.bbsrc.ac.uk/?★HOX Pro同源异型盒(homeobox)基因数据库。 http://spirov.iephb.nw.ru/hox_pro/hox-pro00.html?★OPD,寡核苷酸探针数据库(Oligonucleotide Probe Database)。 /OPD/?★dbSTS,序列标记位点(Sequence Tagged Sites)数据库。 /dbSTS/? (/repository/dbSTS)?★dbEST.这是GenBank的重要组成部分,它包含若干物种的已表达的序列标记信息.? /dbEST/? (/repository/dbEST)?★AmmtDB,后生动物线粒体DNA多序列联配数据库,搜集了脊椎动物线粒