课件：三基因组的结构与功能.pptx

第三章 基因组的结构与功能;问 题;第一节 基因组概论;;一基因组概念;基因组概念;基因组概念;;流感的启示……;SARS和甲型H1N1;两个问题：;解答频繁爆发的流感流行流感病毒基因组— 结构;解答频繁爆发的流感流行流感病毒基因组— 变异;;流感病毒基因组测序的发现;PB1来自 人的H3N2;认识病毒基因组的重大意义;病毒基因组;病毒基因组－1;病毒基因组－2;Φχ174是一种小噬菌体，含有一个环状单链DNA分子，称为正链，感染宿主细胞后，先复制形成负链从而形成双链复制型（RF）DNA分子，其后进行复制直到20－50个左右的RF，然后以RF为模板合成正链φχ174分子。;病毒基因组－3;SARS冠状病毒 SARS coronavirus ; 单股正链RNA、不分节段， 5′端有甲基化帽， 3′端有poly(A)结构。;病毒基因组－4;;病毒基因组－5;病毒基因组－6;有三个基本的结构基因;三个结构蛋白基因：gag-编码病毒衣壳、基质等结构蛋白的基因；pol-编码逆转录酶(p66/p55)、蛋白水解酶和整合酶；env-编码gpl20和gp41两种包膜糖蛋白。有的逆转录病毒还带有癌基因（onc），即有的逆转录病毒有致癌作用。 ;;HIV ;;;;;; ;;病毒基因组中特征序列的结构与功能;LTR（long terminal repeat）;;;;;;;反转录病毒 －基因载体;问 题;三原核生物基因组;类核（nucleoid）：细菌染色体在  细胞内形成的一个致密区域;大肠杆菌染色体结构; 由一条环状双链DNA分子组成， 通常只有一个DNA复制起点。;(二) 结构基因大多组成操纵子; 多个功能相关的结构基因 成簇串联排列，与上游共同的 调控区和下游转录终止信号组 成的基因表达单位。;其它结构特点;四 真核生物基因组;真核生物基因组组装方式;;;;异染色质：碱性染料染色时着色较深的染色质组分 组成型异染色质：所有细胞中均有的一种持久性结构，不含任何基因，总是保持致密的组成状态。除复制期以外，在整个细胞周期均处于聚缩状态，形成多个染色中心 ，如着丝粒和端粒、Y染色体大部分区域 兼性异染色质：非持久性的异染色质，在某些细胞类型或一定的发育阶段, 原来的常染色质聚缩, 并丧失基因转录活性, 变为异染色质，异染色质化可能是关闭基因???性的一种途径 异染色质结构紧密，使控制基因表达的蛋白无法接近 常染色质：指间期核内染色质纤维折叠压缩程度低, 处于伸展状态, 用碱性染料染色时着色浅的那些染色质。常染色质状态只是基因转录的必要条件而非充分条件;;;; 核型（karyotype）：即细胞分裂中期染色体按照大小与着丝粒的位置依次排列，组成的每种生物特有的染色体组图像 ;带型（banding pattern）：某些染料与中期染色体特异性结合使染色体不同部位产生着色差异。 Q带：喹丫因染色 G带：温和蛋白酶处理后吉姆萨染色。右G带图显示，深着色区与浅着色区相间分布，表明染色质的组成是非均一性 R带：加热的碱性溶液处理;人类基因组;第二节 基因组结构;一、基因组大小：;图3.5概括了不同门类生物的C值变化范围。随着生物复杂度的增加，最小基因组的大小也随着增加，但当高等真核生物的DNA总量增加时，我们看到其中一些生物门类的基因组大小也有广泛的变化。;图3.6绘出了每一门类中的一个成员所需要的最小DNA总量，它暗示了组成较复杂的原核生物和较低等的真核生物所需要的最小基因组大小。酵母的基因组约为1.3X107bp,并不比最大的细菌基因组大多少。因此，成为真核生物并不意味着基因组要比原核生物的要大很多。;图3.7列出了一些最普遍应用的模式生物的基因组。图中可以看出随着生物复杂性的增加，基因组的大小也稳定增加。但从两栖类之后的高等生物，基因组的大小与生物形态上的复杂性就没有必然的联系了。;;C值悖论;我们知道基因要比编码蛋白质所需要的序列大许多，因为外显子（编码区域）只是基因全长的一小部分，这就解释了为什么需要更多的DNA，用来为有机体的所有蛋白质提供读框。断裂基因的大部分序列可能跟蛋白质编码没关系，而且在基因之间可能也有相当长的非编码区域。因此，不可能从基因组总的大小来推断基因的数目。;通过分析古细菌和独立生存的最小细菌的基因组，我们鉴定能独立生活的细胞所需要的最小基因数目。最小的古细菌基因组约有1500条基因。具有最小基因组并独立生活的细菌是喜温生物Aquifex aeolicus，它有1.5Mb大小的基因组和1512条基因；一种“典型”的革兰氏阴性细菌流感嗜血杆菌有1743条基因，每条基因的大小约为900bp。由此，我们得出这样一个结论：构成一个独立生活