- 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
从pLink1到pLink2更快、更准的交联肽段鉴定引擎;提纲;背景;以pLink1(Yang et al, 2012)应用为例;pLink1下载591套(2016.5.31);交联鉴定面临三大挑战;交联鉴定面临三大挑战;三个解决方案;三个解决方案;02
引入可碎裂交联剂(湿)
搜索交联肽段n2 搜索两条单肽2n;提纲;技术;技术;FDR估计;从pLink1到pLink2;从pLink1到pLink2;谱图预处理 – 确定母离子单同位素峰;从pLink1到pLink2:搜索空间更精准;从pLink1到pLink2:搜索空间更精准;改进2:从肽段索引到离子索引;改进2:从肽段索引到离子索引;改进2:从肽段索引到离子索引;改进2:从肽段索引到离子索引(Ion-Index);改进3:机器学习(11维特征);改进3:机器学习(SVM在线训练);pLink2与pLink1对比;pLink2与pLink1对比;pLink2与Kojak对比;Kojak的流程与pLink1类似;Kojak的流程与pLink1类似;测试数据集1;搜索Human库;pLink2与Kojak:速度;使用64位的PC进行测试;使用64位的PC进行测试;pLink2与Kojak:精度;pLink2与Kojak:精度;测试数据集二:15N代谢标记;精度:15N代谢标记;精度 - 15N代谢标记;干、湿技术结合:pLink2支持可碎裂交联;干、湿技术结合:pLink2支持可碎裂交联;pLink2支持可碎裂交联;干、湿技术结合:速度提升160倍;总结;总结;总结;总结;谢谢!
文档评论(0)