全基因组重测序研究长期铬胁迫对希瓦氏菌MR-1的影响-中国环境科学.PDFVIP

中国环境科学 2019,39(3) ：1261~1267 China Environmental Science 全基因组重测序研究长期铬胁迫对希瓦氏菌 MR-1 的影响机制 肖长烨 1,2, 肖 勇 1*,赵 峰 1 (1. 中国科学院城市环境研究所,城市污染物转化重点实验室,福建 厦门 361021 ；2. 中国科学 院大学,北 100049) 摘要：在实验室纯培养条件下,设计了希瓦氏菌 MR-1 在恒定浓度 Cr(VI)和 Cr(III)环境中长期胁迫 120d 实验,探讨了胁迫后的菌株对 Cr(VI)的还原能 力和生长情况,采用电化学分析仪表征其电化学性质的变化,并且利用全基因组重测序技术分析了不同条件胁迫后不同阶段的菌株基因变异信息.结果 表明,Cr(VI)长期胁迫下明显提高了菌株对 Cr(VI)的耐受性和还原能力,在 38h 左右能完全还原初始 Cr(VI)浓度 55mg/L;在电位-0.2V 还原峰附近,细胞 色素 c 与核黄素的结合作用有明显差异;通过重测序结果发现, Cr(VI)长期胁迫下的菌株发生突变的基因点位明显高于 Cr(III)环境.Cr(III)环境胁迫下的 非同义突变基因主要集中在葡萄糖转化及合成相关功能的基因、编码呼吸链酶和合成 ATP 酶的相关基因、编码信号转导和跨膜转运蛋白相关基 因,Cr(VI)环境胁迫 120d 后,主要涉及细胞膜组分基因,转运蛋白、信号转导相关基因,DNA 合成、修复相关基因和氧化还原活性相关. 关键词：长期胁迫；还原能力；电化学性质；全基因组重测序 中图分类号：X172 文献标识码：A 文章编号：1000-6923(2019)03-1261-07 Mechanism of long-term chromium stress on Shewanella oneidensis MR-1using whole genome resequencing technique. XIAO Chang-ye1,2, XIAO Yong1*, ZHAO Feng1 (1.Key Laboratory of Urban Pollutant Conversion, Institute of Urban Environment, Chinese Acaderny of Sciences, Xiamen 361021, China ；2.University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China). China Environmental Science, 2019,39(3)：1261~1267 Abstract ：The 120-day long-term stress of constant concentration of Cr(VI) and Cr(III) on Shewanella oneidensis MR-1 was investigated in the present study. The reduction ability of Cr(VI) and growth were explored after the 120-day cultivation. The electrochemical properties were characterized, and the genetic variation of strains at different stages was analysed using whole genome resequencing technology. The results showed that the long-term stress of Cr(VI) significantly improved the tolerance and reducing ability of Cr(VI). The initial Cr(VI) concentration of