群体遗传医学讲义.ppt

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群体遗传医学讲义;群体遗传 ; 群体(population)是由一群可以相互交配的个体组成,因而仅仅从个体的遗传结构难以解释群体的遗传组成及其随时间和空间的变化规律。 ; ;我国不同民族人群; 群体遗传学(population genetics)主要研究群体中基因的分布及逐代传递中影响基因频率和基因型频率的因素,通过数学手段研究基因频率和相对应的表型在群体中的分布特征和变化规律,也是人类遗传学、人类进化和后基因组学研究的中心任务。 ;第一节 群体的遗传平衡 ; 亲代的两个等位基因频率和子代基因型频率;第二代基因型频率;各种婚配的后代基因型分布;表中结果显示: AA后代=p4+2p3q+p2q2=p2(p2+2pq+q2)=p2(p+q)2=p2; Aa后代=2p3q+4p2q2+2pq3=2pq(p2+2pq+q2)=2pq(p+q)2=2pq; Aa后代=p2q2+2pq3+ q4=q2(p2+2pq+q2)=q2(p+q)2=q2 可以看出在这一群体中第一代和第二代的基因型频率是一致的。实际上无论经过多少代,基因型频率将保持不变,每种基因型的个体数量随着群体大小而增减,但是相对频率不变,这就是Hardy-Weinberg平衡的推理。 ;二、Hardy-Weinberg平衡律的应用——Hardy-Weinberg平衡判定 例1:某一基因座的一对等位基因A和a,有三种基因型AA,Aa/aA和aa,在随机1000人的群体中,观察的基因型分布如下: AA为600人 Aa/aA为340人 aa为60人。 ;不同基因型频率的预期值和观察值;X2检验: 当p>0.05时,表示预期值和观察值之间的差异无统计学意义,等位基因频率和基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡, p<0.05时,表示预期值和观察值之间的差异有统计学意义,等位基因频率和基因型频率分布不符合Hardy-Weinberg平衡。;例2:假设某一基因座的一对等位基因B和b,在1000 人群体中,该基因型频率分布是 BB为600人 Bb/bB为320人 bb为80人 ;基因型;经X2检验p<0.05,该基因座随着BB纯合子的减少,Bb杂合子增加,该群体偏离了Hardy-Weinberg平衡。;二、Hardy-Weinberg平衡律的应用——等位基因频率和杂合子频率 例如:常染色体隐性遗传病囊性纤维化在欧洲白种人的发病率约1/2000,患者为突变基因的纯合子q2=1/2000,则q=√1/2000 =1/45=0.022, p=1-1/45=44/45=0.978??杂合子即携带突变基因的个体2pq=2×44/45×1/45=1/23=0.043。 ;第二节 影响遗传平衡的因素;选型婚配(assortative mating),即选择具有某些特征(如身高、智力、种族)的配偶;如果这种选择发生在常染色体隐性遗传性聋哑病患者中,就将增加纯合患者的相对频率; 近亲婚配(consanguineous mating),即有共同祖先血缘关系的亲属婚配,尽管表面上不改变等位基因频率,但可以增加纯合子的比例,降低杂合子数量,因此使不利的隐性表型面临选择,从而又最终改变了后代的等位基因频率。 ;近亲婚配不仅提高了后代的有害隐性基因纯合子的发生风险,而且增加了后代对多基因或多因素疾病的出生缺陷的易感性,这是因为多基因病的患病风险与亲属级别成正比。 亲缘系数(coefficient of relationship,r)是指两个人从共同祖先获得某基因座的同一等位基因的概率。 ;不同亲属级别的亲缘系数;近婚系数:近亲婚配使子女中得到这样一对相同基因的概率,称为近婚系数(inbreeding coefficient,F) ;近婚系数估算(以常染色体上的某一基因座为例) ;S形成纯合子A1A1、A2A2、A3A3、A4A4的总概率:4×(1/2)4=1/4。 一级亲属间的近婚系数就是F=1/4。 ; 舅甥女(或姑侄)之间婚配S成为纯合子A1A1、A2A2、A3A3、A4A4的总概率为4×(1/2)5=1/8,近婚系数F=1/8。 ; 如果是表兄妹婚配,形成A1A1、A2A2、A3A3、A4A4各需传递6步,所以其近婚系数为4×(1/2)6=1/16(右图)。三级亲属的近婚系数F=1/16。 ; 在二级表兄妹婚配的情况下,P1的等位基因A1经B1、C1、D1传递给S需经过4步传递,S为A1A1、A2A2、A3A3、A4A4各需8步传递,其近婚系数为4×(1/2)8=1/64(右图),五级亲属的近婚系数F=1/64。 ;评价近亲婚配对群体的

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