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RNA metabolism Central dogma by F. Crick Part I From DNA to RNA RNA transcription in E coli Template strand vs nontemplate strand 由含?70RNA多聚酶全酶识别的典型大肠杆菌启动子 终止子(terminator)结构 依赖Rho因子的转录终止 RNA transcription in eukaryotic cells 真核细胞三种RNA聚合酶有不同的分工 RNA polymerase I：转录rRNA 前体 RNA polymeraseII：转录mRNA RNA polymeraseIII：转录tRNA,5SrRNA RNA聚合酶III识别的启动子在基因内 爪蟾5S rRNA基因启动子的定位实验分析 Post-transcriptional processing of eukaryotic messenger RNA 真核生物基因的惊人之处 内含子的切除（Splicing） 5’ 帽子的形成 3’ polyA tail的添加 总结 同一mRNA前体可以有不同的产物 Hybridization of chicken ovalbumin mRNA with its genomic DNA，intron存在的直观证据 三类内含子剪接机制的比较 总结：真核生物mRNA的转录和后加工 大鼠降钙素基因转录本（transcript）的替代加工 剪接错误造成?地中海贫血 原核和真核tRNA前体的加工 Part II From RNA to DNA, RNA to RNA RNA-dependent RNA polymerase RNA 编辑（editing）发生在mRNA水平上, 多数为插入碱基 Part III RNA, Origin of Life Traditional theory for the origin of biomolecules Miller等的多肽生成理论 Matthews的多肽生成理论 RNA world 地球上第一个出现的能自我复制的分子是RNA 远古时代生命的主要形式就是RNA分子的各种活动, 切割/剪接/复制/与其他分子的相互作用, etc; RNA上的遗传信息反转录到了更稳定的载体-----DNA 上; 复杂性进一步加大,核酸与蛋白质发生了遭遇; RNA世界的影响至今还在,核糖体中核糖的作用,snRNP中RNA的作用,etc 关于内含子的争论 内含子刚被发现时, 无人理解为什么上帝要做无用功, 为何进化过程中不被抛弃; 一个比较现实的观点是, 内含子的存在帮助了新的基因产生(所谓的exon-shuffling理论); 但是由于内含子只在真核生物中和极少的真细菌(eubacteria)中, 因此对内含子的起源有两种观点: 1、内含子是远古时代有功能的RNA分子相互连接成新的基因时留下来交界处的序列，在细菌中为了适应快速生长的需要而逐渐被去除了；2、内含子是象反转录病毒一样后来插入到始祖细胞的基因组中，导致基因种类的快速增加，进而保留至今。 这场争论中，exon-shuffling理论处于中立状态，它可以被任何一方用作证据； 但是在真核细胞中存在的snRNP帮助mRNA剪接的事实来看，很有可能是一种以RNA为主要生命活动的始祖细胞（带着snRNA和外显子/内含子RNA）寄生到了现代细菌的始祖细胞中去后，接着发生了内含子大量繁殖并有利于新基因产生的事件； 但至今没有证据表面某个内含子可以不借助蛋白质从一个地方跑到另一个地方……。 值得一读的参考书 自私的基因 里查德?道金斯著, 吉林人民出版社 生机勃勃的尘埃 克里斯蒂安?德迪夫著, 上海科技教育出版社 我们为什么生病 R M 尼斯著, 湖南科学出版社 自达尔文以来 斯蒂芬?杰?古尔德著, 三联书店 谁是造物主 乔治?威廉斯著, 上海科技出版社 达尔文的黑匣子 迈克尔?J ?贝希著, 中央编译出版社 熊猫的拇指 斯蒂芬?杰?古尔德著, 三联书店 倾斜的真理 林恩?马古利斯等著 江西教育出版社 许多大肠杆菌噬菌体，如f2, MS2, R17和Qβ均为RNA基因，它们的复制不经过DNA，因此是从RNA到RNA，由RNA-dependent RNA polymerase（或称replicase）催化。Replicase 不能以DNA为模板,也不能以宿主细胞的RNA为模板。 Miller’ experiment ？ ？ 多肽形成的两个不同理论 闪电 紫外线 腺嘌啉可以由五个HCN分子得到核酸的碱基在远古时代由简单的化