RNA代谢生物化学.pptVIP

* * * * * * * * * * * * * * * * * * Part III RNA, Origin of Life Traditional theory for the origin of biomolecules ？ ？ 多肽形成的两个不同理论 闪电 紫外线 Miller等的多肽生成理论 Matthews的多肽生成理论 腺嘌啉可以由五个HCN分子得到核酸的碱基在远古时代由简单的化合物合成 回流 以RNA为模板从短链RNA合成长链RNA分子 RNA可能是第地球上出现的一个能自我复制的分子 I型内含子剪接 SELEX(systematic evolution of ligands by exponential enrichment)获得有特殊功能的RNA分子的过程示意图(左). 与ATP有结合活性的25碱基的RNA分子(下) 也叫Aptmer RNA world 地球上第一个出现的能自我复制的分子是RNA 远古时代生命的主要形式就是RNA分子的各种活动, 切割/剪接/复制/与其他分子的相互作用, etc; RNA上的遗传信息反转录到了更稳定的载体-----DNA 上; 复杂性进一步加大,核酸与蛋白质发生了遭遇; RNA世界的影响至今还在,核糖体中核糖的作用,snRNP中RNA的作用,etc 关于内含子的争论 内含子刚被发现时, 无人理解为什么上帝要做无用功, 为何进化过程中不被抛弃; 一个比较现实的观点是, 内含子的存在帮助了新的基因产生(所谓的exon-shuffling理论); 但是由于内含子只在真核生物中和极少的真细菌(eubacteria)中, 因此对内含子的起源有两种观点: 1、内含子是远古时代有功能的RNA分子相互连接成新的基因时留下来交界处的序列，在细菌中为了适应快速生长的需要而逐渐被去除了； 2、内含子是象反转录病毒一样后来插入到始祖细胞的基因组中，导致基因种类的快速增加，进而保留至今。 这场争论中，exon-shuffling理论处于中立状态，它可以被任何一方用作证据； 但是在真核细胞中存在的snRNP帮助mRNA剪接的事实来看，很有可能是一种以RNA为主要生命活动的始祖细胞（带着snRNA和外显子/内含子RNA）寄生到了现代细菌的始祖细胞中去后，接着发生了内含子大量繁殖并有利于新基因产生的事件； 但至今没有证据表面某个内含子可以不借助蛋白质从一个地方跑到另一个地方……。 值得一读的参考书 自私的基因 里查德?道金斯著, 吉林人民出版社 生机勃勃的尘埃 克里斯蒂安?德迪夫著, 上海科技教育出版社 我们为什么生病 R M 尼斯著, 湖南科学出版社 自达尔文以来 斯蒂芬?杰?古尔德著, 三联书店 谁是造物主 乔治?威廉斯著, 上海科技出版社 达尔文的黑匣子 迈克尔?J ?贝希著, 中央编译出版社 熊猫的拇指 斯蒂芬?杰?古尔德著, 三联书店 倾斜的真理 林恩?马古利斯等著 江西教育出版社 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 细菌中rRNA前体的后加工 脊椎动物中rRNA前体的后加工 原核和真核tRNA前体的加工 原核tRNA没有该内含子 tRNA加工的最后一步－碱基修饰 如：A ? Am （1）甲基化 （2）还原反应 如：U ? DHU （3）核苷内的转位反应 如：U ? ψ （4）脱氨反应 如：A ? I 碱基修饰 四膜虫I型内含子的二级结构 黄色所标碱基部分为内含子 阴影部分为活性所需 端粒酶 (telomerase)是一个很特殊的反转录酶，维系多细胞生物的细胞寿命。 L-19IVS是第一个发现的具有“合成”其他RNA功能的RNA分子 具有催化功能的RNA分子Hammerhead ribozyme Part II From RNA to DNA, RNA to RNA 典型的反转录病毒只有三个基因，但有两个转录本，而翻译出来的蛋白质则有2－3倍的数量。 反转录酶 Rous sarcoma virus的基因组 HIV(human immunodeficiency virus)的基因组 致癌基因是如何跑到反转录病毒基因组里去的 癌基因 oncogene 根据RT的性质设计的抗爱滋病药物 鸡尾酒疗法是合用RT和蛋白水解酶的抑制剂，几乎不会出现抗性 (～10-13)。 许多转座子、反转录病毒和内含子（包括Alu重复序列），可能在进化上拥有相同的起源。 转座子(transposon)与反转录病毒惊人相似 酵母转座子 果蝇转座子 有的内含子中密码了帮助转座的内切酶 端粒酶 (telomerase)是一个很