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Sirtuin家族及其生物学特性
翻译后修饰在细胞中有重要作用,如DNA识别、蛋白 一蛋白相互作用、催化活性和蛋白质稳定性。蛋白乙酰化/ 去乙酰化属于组蛋白共价修饰,主要由组蛋白乙酰化酶和组 蛋白去乙酰化酶分别催化。共有IV类HDAC, sirtuin属于III 类HDAC,与酵母转录抑制因子Si『2同源。Sirtuin蛋白家族 在不同的细胞过程如细胞凋亡、线粒体生物合成、脂质代谢、 脂肪酸氧化、细胞应激反应、胰岛素分泌和衰老都发挥着重 要作用。
家族蛋白结构及酶学功能
蛋白结构
x线晶体衍射显示,细菌、酵母和哺乳动物sirtuin具 有相似的催化核心区域,即275氨基酸残基构成的一大一小 两个基本结构域。较大的结构域由rossmann折叠构成,具有 较强的保守性,较小的结构域含有1个锌指结构 [cys-X-X-Cys-15, 20-Cys-X-X-Cysl 和螺旋构件。底物结合于 两个结构域形成的裂隙发生催化反应。酵母有Sir2和4个 Sir2同源物。哺乳动物sirtuin有7个亚型SIRT1到SIRT7, 其中SIRT1与酵母Sir2在高度保守的核心结构区域序列高度 相似性。对真核生物和原核生物的催化核心区域进行系统分 析可以将sirtuin分为5个主要类别。第1类:5个酵母sirtuins 和人sirtuins中的SIRTk SIRT2和SIRT3;第II类:哺乳动 物SIRT4和来自真核生物以及细菌的sirtuins;第III类:哺乳 动物SIRT5以及古细菌sirtuins,大多数细菌sirtuins也属于 此类;第IV类:包括哺乳动物SIRT6和SIRT7; u类包含革 兰氏阳性菌的sirtuinso
酶学功能
在酿酒酵母中发现了第1个sirtuin,即Sir2,因此sirtuin 酶活性的研究最初均来源于Sir2o用P标记NAD发现人类 同源的酵母Sir2基因可以从NAD转移P到牛血清白蛋白, 表明Sir2具有ADP-核糖基转移酶活性。酵母Sir2对交配型 基因座沉默、端粒DNA沉默和核糖体DNA沉默的转录抑制 具有关键作用。对特定组蛋白亚基的赖氨酸残基进行分析, 更充分说明了 sirtuin的组蛋白去乙酰化作用。Imai等通过对 Sir2反应产物的分析,以及有关Sir2核心区域的保守残基突 变研究的数据支撑下得出体内Sir2是NAD依赖性去乙酰化 酶活性。
Sir2的组蛋白去乙酰化消耗NAD+,伴随去乙酰蛋白、 烟酰胺和0-乙酰基ADP核糖的生成。其催化活性受细胞 NAD+浓度或NAD+/NADH比值变化调节。NAD+合成的限 速酶,烟酰胺转磷酸核糖激酶的细胞水平在不同病理生理条 件下也影响sirtuin活性。烟酰胺酶1基因编码烟酰胺脱去酰 胺基,通过补救途径把NAM转化为烟酸来减少NAM的累 积。由此可见,PNC1和NAM都可以调节细胞中Sir2去乙 酰化酶活性。此外,Sir2去乙酰化反应的另外一个产物 OAADPr,也是一个重要的代谢副产物。OAADPr通过重组 和加载Sir2-4沉默复合物定点结合到核小体调节基因沉默。 因此,Sir2去乙酰化酶活性对细胞的动态平衡具有关键作用。
SIR2是从古细菌到高等生物人类都高度保守的基因 家族,暗示了其保守的催化机制。细菌和古细菌的sirtuin在 转录调控和细胞分化进程中发挥重要作用,比如古细菌的 sirtuin的同源物Cob B,它可以调节丙酸分解代谢和钻胺素 的酶生物合成,在NAD+依赖条件下去乙酰基并激活乙酰 -CoA,并且能够将染色质Alba去乙酰化,调节DNA稳定性 及转录活性。这些研究表明,真核生物原核生物以共同的机 制对赖氨酸进行乙酰化调节,以及细菌应激反应条件下的乙 酰化、去乙酰化作用。因此,Sir2同时具有NAD+依赖性去 乙酰化酶活性和单ADP核糖基转移酶活性。
家族成员的生物学特性
哺乳动物sirtuin广泛分布于细胞,具有不同的亚细胞 定位,其功能也不相同。SIRT1、SIRT6和SIRT7主要是核蛋 白,SIRT3、SIRT4和SIRT5分布于线粒体,而SIRT2主要 存在于细胞质。研究显示,SIRT1-3有较强的去乙酰化酶活 性,SIRT4-7则较弱或检测不到去乙酰化酶的活性,而SIRT4 主要表现ADP-核糖基转移酶活性。哺乳动物sirtuin的亚细 胞定位、作用底物及功能如表1所示。
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STRT1是酵母Sir2基因的同源基因,也是目前研究最 多的,在胚胎发育及骨骼肌分化都具有重要作用,参与染色 质修饰、表观遗传学、炎症和应激反应,与组蛋白和一些非 组蛋白底物相互作用。其中非组蛋白底物包括肿瘤抑制基因 p53、核因子-KB、过氧化物酶体增殖子激活受体y共激活因 子1-a、FOXO、肝x受体、PARP、Ku70和低氧诱导因子-la
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