实验室常用试验方法.docxVIP

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实验室常用试验方法 总RNA的提取(Trizol法提取〉 在收集到生物材料之后,最好能即刻进行RNA制备工作。若需暂时储存, 则应以液氮将生物材料急速冷冻后,储存于?80°C冷冻柜。在制备RNA时, 将储存于冷冻柜的材料取出,立即以加入液氮研磨的方式打破细胞,不可以 先行解冻,以避免RNase的作用。 1. 提取组织RNA时,每50?lOOmg组织用1ml Trizol试剂对组织进行裂解; 提取细胞RNA时,先离心沉淀细胞,每5-10 X106个细胞加1 ml Trizol后, 反复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞; 2. 将上述组织或细胞的Trizol裂解液转入EP管中,在室温15?30C下放置5分钟; 3. 在上述EP管中,按照每lml TRIZOL加0.2ml氯仿的量加入氯仿,盖上EP 管盖子,在手中用力震荡15秒,在室温下(15°C?30°C)放置2?3分钟后, 12000g (2°C~8°C)离心 15 分钟; 4. 取上层水相置于新EP管中,按照每lml TRIZOL加0.5ml异丙醇的量加入异丙 醇,在室温下(15°C?30°C)放置10分钟,12000g (2°C?8°C)离心10分钟; 5. 弃上清,按照每lml TRIZOL加1 ml 75%乙醇进行洗涤,涡旋混合,7500g (2°C~8°C)离心5分钟,弃上清; 6. 让沉淀的RNA在室温下自然干燥; 7. 用 Rnase-free water 溶解 RNA 沉淀。 PCR 实验室常用DM 聚合酶有三种:TaKaRa TaqTM, TaKaRa EXTaqTM和 PyrobestTM DNA Polymeraseo TaKaRa TaqTM 是一般的 DNA 聚合酶, 保真性较差,但价钱便宜,一般用于基因表达的检测等。TaKaRa EXTaqTM是具有Proof reading活性的耐热性DNA聚合酶,具有一定 的保真性,而且其扩增得到的PCR产物3端附有一个“A”碱基, 如果希望直接将产物克隆到T-vector可以用此酶。PyrobestTM DNA Polymerase也是具有Proof reading活性的耐热性DNA聚合酶,其 特点是保真性极高,扩增得到的PCR产物为平滑末端。如果进行基 因的扩增请使用此酶。 1. 按下列组成在PCR反应管中调制反应液: TaKaRa TaqTM 或 TaKaRa EXTaqTM 的配方 Reagent Quantity, for 50)li 1 of reaction mixture 10X PCR buffer (Mg2+ free) 5 |il MgC12 (25mM) 如 TaKaRa TaqTM 力口 3 卩 1 如 TaKaRa EXTaqTM 加 4 卩 1 2.5mM dNTP mix 4 pl 10|iM Pr imer 上游 1 |il 10pM Pr imer 下游 1 pl Template DNA 1 I Taq 或 EXTaqDNA Polymerase 0. 25 pl Sterile deionized water Up to 50|il Tota I 50 (il /SampIe PyrobestTM DNA Polymerase 的配方 Reagent Quantity, for 50|nl of reaction mixture 1 OX Pyrobest buffer 5|il 2.5mM dNTP mix 4)il 10|iM Pr imer 上游 10|iM Pr imer 下游 1)il Template DNA 1 pl PyrobestTM DNA PoIymerase 0. 25p l Sterile deionized water Up to 50p1 Tota I 50|i 1 /Samp 1 e ① 反应总体积根据实际情况进行调控,可以做20~50卩1以节约试剂; ② 将上表各成分加入到0.2ml或0.5ml灭菌的PCR薄壁管中; ③ 如果不用PCR仪的加热盖,在反应混合液的上层加30~50卩1的矿物油防止 样品在PCR的过程中蒸发: 2. 按以下程序进行PCR扩增。 PCR反应条件视模板、引物等的结构条件不同而各异,在实际操作中需根据 具体的情况以及P C R结果而进行优化。 Step Temperature, °C Time, min Number of cycles Note 起始 变性 94 ?95 1-3 1 变性 94 ?95 0.5-2 25-35 退火温度比理论退 火温度大概低5°C, 再根据反应结果优 化 退火 37-70 0.5-2 延伸 70-75 根据扩增产物 的大小 每分钟延伸lOOObp 最终 延伸 70-75 10 1

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