试验用SPF大白猪和长白猪母系遗传结构分析MaternalGenetic.pdfVIP

Online system: 农 业 生 物 技 术 学 报 Journal of Agricultural Biotechnology 2019, 27(1): 97~107 DOI: 10.3969/j.issn. 1674-7968.2019.01.011 实验用SPF 大白猪和长白猪母系遗传结构分析 1,2 2 2 2 1,2* 辛畅 高彩霞 权金强 马璐璐 陈洪岩 1 东北农业大学生命科学学院，哈尔滨150030；2 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所/兽医生物技术国家重点实验室/黑龙江省实验动物 与比较医学重点实验室，哈尔滨150069 *通讯作者，sydw2014@163.com 摘 要 无特定病原体(specific pathogen free, SPF)大白猪(Susscrofa)和长白猪作为重要的实验动物，其 遗传学质量控制研究十分必要。为分析实验用SPF 大白猪、长白猪的线粒体DNA(mitochondrial DNA, mtDNA)控制区(displacement-loop region, D-loop 区)遗传多样性，揭示其母系遗传结构，本研究提取SPF 大白猪和长白猪基因组DNA ，同时以我国地方品种巴马小型猪和融水小型猪为对照，应用PCR 技术扩增 其mtDNA D-loop 区，进行测序比对。结果显示，107个样本中共检测到40 个多态位点，分为13个单倍型， 与地方品种相比，大白猪和长白猪单倍型数较少，分别含有3 种和2 种特有单倍型，只有1个共享单倍型 H4 。两猪群中各存在1个优势单倍型。单倍型多样度(Hd)分析，融水小型猪单倍型多样度最高(0.767) ， 长白猪最低(0.429) ，大白猪和巴马小型猪分别为0.566 和0.503 。此外，中介网络关系图和系统进化树发 现大白猪和长白猪与欧洲猪种亲缘关系较近。本研究表明实验用SPF 大白猪和长白猪种群的单倍型数 较少，各存在1个优势单倍型，遗传多样性低，具有清晰的母系遗传结构。研究结果有利于进一步的实验 动物标准化以及遗传质量控制研究。 关键词 无特定病原体(SPF)猪，mtDNA ，控制区，母系遗传结构 中图分类号 S813.3 文献标识码 A Maternal Genetic Structure Analysis of Experimental SPF Yorkshire (Sus scrofa) and Landrace Population XIN Chang1,2 GAO Cai-Xia2 QUAN Jin-Qiang2 MA Lu-Lu2 CHEN Hong-Yan1,2* 1 College of Life Science, Northeast Agricultural University, Harbin 150030, China; 2 State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Heilongjiang Provincial Key Laboratory of Laboratory Animal and Comparative Medicine, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Harbin 150069, China * Corresponding author, sydw2014@163.com Abstract The genetic quality control research is very necessary for specific pathogen free (SPF) Yorkshire (Susscrofa) and Landrace pig populations used as the important experimental animals. To analyze the genetic diversity of the mitochond