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目 录
中文摘要Ⅰ
英文摘要 ….Ⅲ
前 言 1
1 材料与方法 3
1.1 实验材料 3
1.1.1 生物信息学分析材料 3
1.1.2 主要试剂 3
1.1.3 主要仪器4
1.2 实验方法 5
1.2.1 人和小鼠DGKδ 生物信息学分析 5
1.2.2 取材 6
1.2.3 皮肤组织总RNA 的提取纯化、反转录和分析 6
1.2.4 皮肤组织蛋白提取和分析 8
1.2.5 免疫组织化学ABC 法染色 9
1.2.6 统计学分析 10
2 结 果 11
2.1 人和小鼠DGKδ 生物信息学分析 11
2.1.1 人DGKδ 在各组织中的表达水平分析 11
2.1.2 人DGKδ 转录因子预测 11
2.1.3 人DGKδ 信号肽和跨膜结构域的预测 12
2.1.4 人DGKδ 亚细胞定位的预测 13
2.1.5 人DGKδ 同源性分析 13
2.1.6 小鼠DGKδ 转录因子预测 15
2.2 Real-time PCR 15
2.3 Western bloting 16
2.4 免疫组织化学ABC 法染色 17
3 讨 论 22
结 论25
参考文献 26
综 述29
参考文献 33
致 谢 35
个人简历 36
山西医科大学硕士学位论文
DGKζ 、PKCβⅡ在不同毛色小鼠背部皮肤中的表达和定位
摘要
目的:
探讨甘油二酯激酶δ(diacylglycerol kinase δ ,DGKδ )、蛋白激酶CβⅡ(protein kinase
CβⅡ,PKCβⅡ )在不同毛色小鼠背部皮肤中的表达、定位及其与毛色形成的相关性。
方法:
1. 通过美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology
Information,NCBI )官网,获取人和小鼠DGKζ 的序列;运用多种在线生物信息学
分析平台对人DGKζ 在各器官组织中的表达及其转录因子、编码产物的信号肽、跨膜
结构域、亚细胞定位预测分析,并对人DGK ζ的同源性进行分析;对小鼠DGKζ 序
列启动子所结合的转录因子进行预测。
2. 取2M 白、灰和黑色小鼠各6 只,去毛取背部皮肤,行Real-time PCR、Western
blotting 和免疫组织化学ABC 法染色技术检测。
结果:
1. 生物信息学分析结果表明:DGKζ 在人体皮肤中表达;预测的人DGKζ 启动子
可能结合的22 个转录因子中ER-alpha、Sp1、p53 、c-ets- 1 和YYY1 这5 个转录因子
在黑素细胞中表达;人DGKζ 编码产物不存在信号肽剪切位点属非分泌蛋白,无跨膜
区域;主要定位于细胞核,亦定位在细胞质;人与黑猩猩、马、猫、灰仓鼠、牛、豚
鼠、野猪、大鼠、小鼠和鸡DGKδ 的氨基酸同源性分别为 99.8%、98.3%、97.7%、
96.6%、96.6%、96.4%、96.3% 、96.0%、96.0%、94.6%和78.6%,系统进化树分析发
现人与黑猩猩亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远。预测的小鼠DGKζ 启动子可能结
合的13 个转录因子中ER-alpha、p53 和YYY1 这3 个转录因子在黑素细胞中表达。
2. Real-time PCR 检测显示,DGKδ 、PKCβⅡ在三种毛色小鼠背部皮肤中mRNA
表达趋势一致,均为:灰色组>白色组;黑色组>白色组,其差异具有统计学意义
(P0.05 );Western blotting 检测表明,显示PKCβⅡ活性的p-PKCβⅡ/ PKCβⅡ ,其变
I
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