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基于综合生物信息学的宫颈癌预后模型建立及低叶酸刺激 Shh/SPP1 信号轴促进宫
颈癌细胞的作用分析 I
摘 要 I
Establishment of cervical cancer prognosis model based on comprehensive
bioinformatics and analysis of the role of hypofolate in stimulating the
Shh / SPP1 signal axis to promote cervical cancer cells III
Abstract III
常用缩写词中英文对照表 V
前 言 1
第一部分 影响CIN1 进展预警因素分析:基于山西CIN 前瞻性队列研究 2
1 对象和方法 3
1.1 研究对象 3
1.2 主要仪器与试剂 4
1.3 临床实验室检测 5
1.4 统计学方法 5
2 结果 6
2.1 研究对象的人口学特征 6
2.2 研究对象的实验室检测和病理学指标 7
2.3 影响 CIN1 患者转归的因素分析 8
2.4 HPV 阴性CIN1 患者疾病进程的亚组分析8
2.5 CIN1 进展为 CIN2+的Kaplan-Meier 和 COX 模型构建 9
2.6 CIN1 转归的多因素 COX 比例模型评分表及预测价值 10
3 讨论 12
4 结论 13
4.1 HPV 与 CIN1 疾病进展 13
4.2 人口学特征与 CIN1 疾病进展 13
4.3 实验室检测和病理学指标 13
4.4 CIN1 疾病进展临床预测模型 13
参考文献 14
第二部分 综合生物信息学分析鉴定宫颈癌发病机制和预后的生物标志物 16
1 对象和方法 16
1.1 研究对象 16
1.2 生物信息学数据库 16
1.3 生物信息学处理工具 18
1.4 统计学方法 19
2 结果 19
2.1 GEO 数据库联合分析 19
2.2 GTEX 和 TCGA 数据库联合分析 20
2.3 差异基因生物学功能和信号通路分析 21
2.4 差异基因蛋白质-蛋白质相互作用分析(protein-protein interaction, PPI)
22
2.5 宫颈癌差异基因的免疫微环境分析 23
2.6 宫颈癌预后基因分析 23
3 讨论 27
4 结论 28
4.1 寻找到影响宫颈癌发生发展的中枢基因 28
4.2 宫颈癌肿瘤微环境分析 28
4.3 构建预测宫颈癌预后的多基因和临床资料模型 28
参考文献 28
第三部分 低叶酸影响Shh/SPP1 信号轴增加siha 细胞致癌性 30
1 对象和方法 30
1.1 研究对象 30
1.2 主要仪器与试剂 30
1.3 实验方法32
1.4 统计分析 34
2 结果 35
2.1 宫颈癌预后相关基因筛选 35
2.2 低叶酸增强 siha 细胞细胞增殖 35
2.3 低叶酸增加 siha 细胞伤口愈合能力和侵袭能力 36
2.4 低叶酸增加 siha 细胞 Shh 和 SPP1 蛋白表达37
3 讨论 38
4 结论 39
4.1 SPP1 在宫颈癌患者中高表达,且高表达往往患者预后较差 39
4.2 低叶酸可激活 Hedgehog 信号通路,增加 Shh 表达,从而增加 siha 细胞的增殖
和侵袭 39
4.3 低叶酸可以增加 Shh 表达,激活 Hedgehog 信号通路,促进宫颈癌细胞的增殖和
侵袭能力。 39
参考文献 39
综述 41
致 谢 47
山西医科大学硕士学位论文
基于综合生物信息学的宫颈癌预后模型建立及低叶酸刺激
Shh/SPP1 信号轴促进宫颈癌细胞的作用分析
摘 要
目的:
1.分析影响 CIN1 患者进展的危险因素,并建立预测模型;
2.利用综合生物信息学分析,筛选与宫颈癌患者预后相关的基因,构建宫颈癌
患者预后模型,为之后的基础实验提供参考;
3.通过细胞实验,结合生物信息学,验证叶酸在宫颈癌作用中的分子机制,为
之后的临床治疗提供理论基础。
方法:
1.通过对课题组一项队列研究进行分析,利用临床流行病学分析影响 CIN1 进
展的危险因素,使用Nomogram 构建预后评分表;
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