基于综合生物信息学的宫颈癌预后模型建立及低叶酸刺激Shh_SPP1信号轴促进宫颈癌细胞增殖和侵袭的作用.pdfVIP

基于综合生物信息学的宫颈癌预后模型建立及低叶酸刺激Shh_SPP1信号轴促进宫颈癌细胞增殖和侵袭的作用.pdf

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目录 基于综合生物信息学的宫颈癌预后模型建立及低叶酸刺激 Shh/SPP1 信号轴促进宫 颈癌细胞的作用分析 I 摘 要 I Establishment of cervical cancer prognosis model based on comprehensive bioinformatics and analysis of the role of hypofolate in stimulating the Shh / SPP1 signal axis to promote cervical cancer cells III Abstract III 常用缩写词中英文对照表 V 前 言 1 第一部分 影响CIN1 进展预警因素分析:基于山西CIN 前瞻性队列研究 2 1 对象和方法 3 1.1 研究对象 3 1.2 主要仪器与试剂 4 1.3 临床实验室检测 5 1.4 统计学方法 5 2 结果 6 2.1 研究对象的人口学特征 6 2.2 研究对象的实验室检测和病理学指标 7 2.3 影响 CIN1 患者转归的因素分析 8 2.4 HPV 阴性CIN1 患者疾病进程的亚组分析8 2.5 CIN1 进展为 CIN2+的Kaplan-Meier 和 COX 模型构建 9 2.6 CIN1 转归的多因素 COX 比例模型评分表及预测价值 10 3 讨论 12 4 结论 13 4.1 HPV 与 CIN1 疾病进展 13 4.2 人口学特征与 CIN1 疾病进展 13 4.3 实验室检测和病理学指标 13 4.4 CIN1 疾病进展临床预测模型 13 参考文献 14 第二部分 综合生物信息学分析鉴定宫颈癌发病机制和预后的生物标志物 16 1 对象和方法 16 1.1 研究对象 16 1.2 生物信息学数据库 16 1.3 生物信息学处理工具 18 1.4 统计学方法 19 2 结果 19 2.1 GEO 数据库联合分析 19 2.2 GTEX 和 TCGA 数据库联合分析 20 2.3 差异基因生物学功能和信号通路分析 21 2.4 差异基因蛋白质-蛋白质相互作用分析(protein-protein interaction, PPI) 22 2.5 宫颈癌差异基因的免疫微环境分析 23 2.6 宫颈癌预后基因分析 23 3 讨论 27 4 结论 28 4.1 寻找到影响宫颈癌发生发展的中枢基因 28 4.2 宫颈癌肿瘤微环境分析 28 4.3 构建预测宫颈癌预后的多基因和临床资料模型 28 参考文献 28 第三部分 低叶酸影响Shh/SPP1 信号轴增加siha 细胞致癌性 30 1 对象和方法 30 1.1 研究对象 30 1.2 主要仪器与试剂 30 1.3 实验方法32 1.4 统计分析 34 2 结果 35 2.1 宫颈癌预后相关基因筛选 35 2.2 低叶酸增强 siha 细胞细胞增殖 35 2.3 低叶酸增加 siha 细胞伤口愈合能力和侵袭能力 36 2.4 低叶酸增加 siha 细胞 Shh 和 SPP1 蛋白表达37 3 讨论 38 4 结论 39 4.1 SPP1 在宫颈癌患者中高表达,且高表达往往患者预后较差 39 4.2 低叶酸可激活 Hedgehog 信号通路,增加 Shh 表达,从而增加 siha 细胞的增殖 和侵袭 39 4.3 低叶酸可以增加 Shh 表达,激活 Hedgehog 信号通路,促进宫颈癌细胞的增殖和 侵袭能力。 39 参考文献 39 综述 41 致 谢 47 山西医科大学硕士学位论文 基于综合生物信息学的宫颈癌预后模型建立及低叶酸刺激 Shh/SPP1 信号轴促进宫颈癌细胞的作用分析 摘 要 目的: 1.分析影响 CIN1 患者进展的危险因素,并建立预测模型; 2.利用综合生物信息学分析,筛选与宫颈癌患者预后相关的基因,构建宫颈癌 患者预后模型,为之后的基础实验提供参考; 3.通过细胞实验,结合生物信息学,验证叶酸在宫颈癌作用中的分子机制,为 之后的临床治疗提供理论基础。 方法: 1.通过对课题组一项队列研究进行分析,利用临床流行病学分析影响 CIN1 进 展的危险因素,使用Nomogram 构建预后评分表;

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