1.转录组
2高通量测序
·3.转录组数据分析
4.差异表达基因分析
·5趋势性上调和下调基因分析
6.基因集功能富集分析
1. 1 transcriptome
转录组( transcriptome)是指特定生物体在某种状态或某一生
理条件下,细胞内所有基因转录产物的总和,包括信使RNA
核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有
mRNA的集合。
从RNA层次研究基因表达的情况,即为转录组学(
transcriptomics),是研究细胞表型和功能的一个重要手段。
12转录组研究的重要性
〉转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的纽带,转
录水平的调控是最重要也是目前研究最广泛的生物体调控方式
转录组的研究比基因组的研究能给出更高效的有用信息
与基因组不同,转录组更有时间空间性。除了异常的mRNA降解
现象(如转录衰减)以外,转录组反映的是特定条件下活跃表达
的基因
转录组的研究可以提供什么条件下什么基因表达什么信息,从而
推断相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制
对转录本的定量可以了解特定基因的活性和表达量,用于疾病的
诊断和治疗
通过对转录组的研究,也让个性化医疗的目标,从共性转移到个
性,成为可能
1.3转录组研究的技术
主要包括如下三种:
1)基于杂交技术的微阵列技术;
2)基
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