差异表达基因分析趋势性上调与下调基因分析基因集功模板.ppt

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1.转录组 2高通量测序 ·3.转录组数据分析 4.差异表达基因分析 ·5趋势性上调和下调基因分析 6.基因集功能富集分析 1. 1 transcriptome 转录组( transcriptome)是指特定生物体在某种状态或某一生 理条件下,细胞内所有基因转录产物的总和,包括信使RNA 核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有 mRNA的集合。 从RNA层次研究基因表达的情况,即为转录组学( transcriptomics),是研究细胞表型和功能的一个重要手段。 12转录组研究的重要性 〉转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的纽带,转 录水平的调控是最重要也是目前研究最广泛的生物体调控方式 转录组的研究比基因组的研究能给出更高效的有用信息 与基因组不同,转录组更有时间空间性。除了异常的mRNA降解 现象(如转录衰减)以外,转录组反映的是特定条件下活跃表达 的基因 转录组的研究可以提供什么条件下什么基因表达什么信息,从而 推断相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制 对转录本的定量可以了解特定基因的活性和表达量,用于疾病的 诊断和治疗 通过对转录组的研究,也让个性化医疗的目标,从共性转移到个 性,成为可能 1.3转录组研究的技术 主要包括如下三种: 1)基于杂交技术的微阵列技术; 2)基

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