11转录组学1 生物信息学PPT技术文档.pptxVIP

转录组学1陈小舒2019.5.14转录组学以DNA为模板合成RNA的转录过程，是基因表达的第一步，是基因表达调控的关键环节。转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和。与基因组不同的是，转录组包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及环境下，其转录组是不完全相同的。转录组学是指一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。RNA在细胞中，根据结构功能的不同，RNA主要分三类：mRNA (信使RNA)，是合成蛋白质的模板；tRNA (转运RNA ) ，是mRNA上碱基序列的识别者和氨基酸的转运者；rRNA (核糖体RNA ) ，是组成核糖体的组分，是蛋白质合成的场所。mRNAmRNA从5′末端到3′末端的结构依次是5′帽子结构，5′末端非编码区，决定多肽氨基酸序列的编码区，经过剪接，被去掉了一些片段(intron)，余下的片段(exon)被重新连接在一起。3′末端非编码区，多聚腺苷酸(polyA)尾巴cDNA由于mRNA容易受RNA酶的攻击反应而降解，加上RNA酶极为稳定且广泛存在，因而在提取过程中要严格防止RNA酶的污染，并设法抑制活性，同时尽快将mRNA反转录成cDNA (complementary DNA，互补DNA) 。主要内容高通量检测RNA表达量的研究历程RNA-seq的实验平台RNA-seq的实验方法RNA-seq的其他应用高通量检测RNA