4生物信息学-李伟忠-2序列比对b 生物信息学PPT技术文档.pdfVIP

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4生物信息学-李伟忠-2序列比对b 生物信息学PPT技术文档.pdf

李伟忠 序列比对  序列比对的概念  Pairwise (两序列)比对  比对工具  Smith-Waterman 算法详解  BLAST 子程序  FASTA 子程序  短序列比对  迭代比对  多重序列比对  基因组(长序列)比对 序列比对  序列比对的概念  Pairwise (两序列)比对  迭代比对  多重序列比对  基因组(长序列)比对 迭代比对  迭代检索Iterative Search  多个检索的循环  目的是寻找远程同源序列  工具: ○ PSISearch 系列 ○ PSIBLAST ○ JackHmmer  HOE 错误– 同源过度延申错误 迭代比对 Gonzalez and Pearson, 2010 迭

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