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- 2020-09-15 发布于江苏
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李伟忠
序列比对
序列比对的概念
Pairwise (两序列)比对
比对工具
Smith-Waterman 算法详解
BLAST 子程序
FASTA 子程序
短序列比对
迭代比对
多重序列比对
基因组(长序列)比对
序列比对
序列比对的概念
Pairwise (两序列)比对
迭代比对
多重序列比对
基因组(长序列)比对
迭代比对
迭代检索Iterative Search
多个检索的循环
目的是寻找远程同源序列
工具:
○ PSISearch 系列
○ PSIBLAST
○ JackHmmer
HOE 错误– 同源过度延申错误
迭代比对
Gonzalez and Pearson, 2010
迭
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