(完整版)蛋白质四级结构及其检测方法.docVIP

论述一、二、三、四级蛋白质结构及其检测方法？ 蛋白质定义： 由一条或多条多肽链以特殊方式结合而成的生物大分子， 通常是将分子量 在 6000 道尔顿以上的多肽称为蛋白质。 一、蛋白质一级结构： （一） 定义：蛋白质的一级结构又称为共价结构或化学结构， 它是指蛋白质中的氨基酸按照 特定的排列顺序通过肽键连接起来的多肽链结构。 氨基酸残基主要通过肽键连接， 有些蛋白 质中含有二硫键。 （二）检测方法： 二硝基氟苯（ DNFB ）法、丹磺酰氯法、氨肽酶法、 C-末端氨基酸测定（肼解法、还原法、羧肽酶法） 二、蛋白质二级结构： （一） 定义：蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构， 即该段肽链主链骨架原子的相对空 间位置，只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。并不涉及氨基酸残基侧链的构 象 。主要的化学键为氢键。 （二）检测方法： 构象的研究方法： X 射线衍射法、核磁共振光谱法、圆二色谱 CD 、紫外 -可见差光谱、 荧光探针法、激光拉曼光谱法、红外光谱法、关联规则与遗传算法。 三、蛋白质三级结构： （一） 定义：整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。 即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。主要的化学键：疏水键、离子键、二硫键、氢键和配位键稳定维系三级结构的作 用。 （二）检测方法： 同源建模（比较建模 SWISS-MODEL ）法、穿针引线方法（折叠识别方法） 、从头预测法、最速下降法、 牛顿法、 共轭梯度法、遗传算法、 分解 -结合法、离散化方法、分子动力学法、混合预测方法、 粒子群优化算法 (PSO)。 四、蛋白质四级结构： （一）定义：有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链，每一条多肽链都有完整的三级结构， 称为蛋白质的亚基。 蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用， 称 为蛋白质的四级结构。亚基之间的结合力主要是疏水作用，其次是氢键和离子键。 （二）检测方法： 线性降维法： Swiss-Prot 数据库中抽取数据集进行四级结构预测。 Quat-PRE 方法：综合运用 mRMR 方法和 SVM 的 wrapper 方法进行四级结构预测。 最近邻居算法： 从蛋白质一级序列出发， 利用蛋白质序列氨基酸组成、 二肽组成以及混 合组成方法对蛋白质单聚体、二聚体、三聚体、四聚体、五聚体、六聚体和八聚体进行分类研究。