分子生物学课件 第一章 氨基酸序列中的功能性密码.pptVIP

第一章 氨基酸序列中的功能性密码 第一节 氨基酸序列的合成 第二节 氨基酸序列与蛋白质分选 第三节 氨基酸序列与信号肽 第四节 氨基酸序列与导肽 第五节 氨基酸序列与蛋白质折叠 第六节 氨基酸序列与酶的活性 第七节 氨基酸序列与细胞凋亡 第一节 氨基酸序列的合成 氨基酸彼此在核糖体上缩合成多肽链，是通过核糖体循环而实现的。此循环可分为肽链合成的起始(intiation)，肽链的延伸(elongation)和肽链合成的终止(termination)三个主要过程。 1 肽链合成的起始 2 肽链的延伸 这一过程包括进位、肽键形成、脱落和移位等四个步骤。肽链合成的延长需两种延长因子(Elongation factor，简写为EF)，分别称为EF-T和EF-G 。此外尚需GTP供能以加速翻译过程。 进位： 　即新的氨基酰-tRNA进入50S大亚基A位，并与mRNA分子上相应的密码子结合。此步需GTP、EF-T及Mg2+的参与。 肽键形成： 　在大亚基上肽酰转移酶的催化下，将P位点上的tRNA所携带的甲酰甲硫氨酰(或肽酰基)转移给A位上新进入的氨基酰-tRNA的氨基酸上，即由P位上的氨基酸(或肽的羧基端氨基酸)提供α-COOH基，与A位上的氨基酸的α-NH2基形成肽链。此步需Mg2+及K+的存在。 脱落： 　即50S亚基P位上无氨基酸负载的tRNA脱落。 移位： 　指在EF-G和GTP的作用下，核糖体沿mRNA链(5→3)作相对移动。每次移动相当于一个密码子的距离，使得下一个密码子能准确的定位于A位点处。 3肽链合成的终止 肽链合成的终止，需终止因子或释放因子(releasing factor，简写为RF)参与 。 RF具有识别mRNA链上终止密码子使肽链释放，核糖体解聚的作用。 第二节 氨基酸序列与蛋白质分选 　　　细胞内合成的蛋白质之所以能够定向的转运到特定的细胞器，取决于两个方面： 其一是蛋白质中包含特殊的信号序列（signal sequence or targeting sequence ）， 其二是细胞器上具特定的信号识别装置（分选受体，sorting receptor）。 两类蛋白质分选信号： ①信号序列（signal sequence）：存在于蛋白质一级结构上的线性序列，通常15-60个氨基酸残基，有些信号序列在完成蛋白质的定向转移后被信号肽酶（signal peptidase）切除。 ②信号斑（signal patch）：存在于完成折叠的蛋白质中，构成信号斑的信号序列之间可以不相邻，折叠在一起构成蛋白质分选的信号。 哺乳动物细胞大约含有 10, 000 种蛋白质， 酵母约含 5, 000 种 除了少量的蛋白质由线粒体和叶绿体 DNA 编码外，其余蛋白质都是由细胞核 DNA 编码，在细胞质（cytosol）游离核 糖体（free ribosomes）上合成 细胞要发挥正常功能，必须使每一个蛋白 质都要在膜（细胞膜，细胞器膜）或水相 腔室（细胞质，细胞器基质或内膜腔）中 正确定位。 如： 1、受体蛋白、离子通道蛋白和转运蛋白需要嵌在质 膜内； 2、 DNA 、RNA 聚合酶需送到核（nucleus ） ； 3、蛋白酶（proteolytic enzymes）和过氧化氢酶 （catalase）应分别转运至溶酶体（lysosome） 和过氧化物酶体（peroxisome）； 4、其他如细胞外间质（ECM）和激素则需要分泌到 细胞外。 蛋白质的转运 一、信号序列（斑块）、跨膜疏水区和分拣信号 二、伴侣蛋白（chaperone） 三、翻译同步转运和翻译后转运 一、信号序列（斑块）、跨膜疏水区 和分拣信号 1. 信号序列（斑块） 2. 跨膜疏水区 3. 分拣信号 1. 信号序列（斑块）（signal sequece/patch） 内质网（endoplasmic reticulum, ER）信号序列： 存在于所有分泌蛋白质的前体中。一般位于肽链 N-terminus ，引导新生肽从细胞质进入内质网。 基质（matrix）信号序列：引导新合成的蛋白质经过跨 膜转运从细胞质进入细胞器基质。 内膜腔（intermembrane space）信号序列： 新合成的蛋白质进入基质后，基质信 号序列被切除，然后由内膜腔信号序 列引导蛋白质进入内膜腔（即内、 外膜间隙）。 信号斑块：蛋白质分子中由于肽链折叠而使 互不连续的肽段相互靠拢，而构成的 局部立体结构，其功能与信号序列相 似。 信 号 斑 块：蛋白质分子中由于肽链折叠而使互不连续的肽段相互靠近构成的局部立体结构，其功能与信号序列相似。 2.跨膜疏水区 信号-锚定序列（signal-anchor sequence）：引 导新生肽链从细胞质进入内质网并锚定