三个（半）矮秆水稻基因的遗传分析和基因定位.pdfVIP

摘 要 株高直接影响水稻生物产量和抗倒伏能力，是影响水稻产量的重要农艺性状之一。“绿色革 命基因”sd1大幅度提高了水稻的产量。然而，单一矮秆基因的使用会造成遗传背景狭窄、杂种 优势利用局限、缺少遗传多样性等问题。因此，挖掘和研究新的矮秆基因可以拓宽水稻矮秆育种 的遗传基础并更加深入了解有关水稻株高的分子机制。矮杆基因sdq(t)和sde(t)为本课题组分别从 地方品种黔农和特矮中分离获得的与sd1不等位的两个新半矮杆基因，而dn(t)为从浙江矮秆品种 丛腊矮携带的新矮秆基因。本研究以携带有sdq(t)、sde(t)和丛腊矮的dn(t)基因的三个中选5 号高 秆突变体 （ZX5T）的近等基因系为研究对象，开展了农艺性状考察、表型及遗传分析和基因定 位等方面的研究，同时对sdq(t)和sde(t)进行了精细定位。主要结果如下： 1. 从双矮秆地方品种黔农中分离得到 1份携带sdq(t) 的半矮秆材料新黔矮，以高秆突变体 ZX5T 为轮回亲本，以新黔矮为供体亲本，育成了ZX5T 的近等基因系ZX5T-sdq （以下简称sdq）。 与ZX5T 相比，sdq 除了第一节间比例显著增加，其他节间均等比例缩短，表明sdq 是 “d6”类 型的矮秆突变体。通过细胞学观察分析发现，sdq 整个第二节间细胞数目极显著减少，纵切面细 胞长度极显著缩短，推测sdq 第二节间缩短是由细胞数目减少和细胞长度缩短共同决定的，其半 矮秆性状是由于细胞分裂和伸长同时受到影响。外源激素处理实验表明sdq 对赤霉素 （GA ）较 3 为敏感，对油菜素内酯 （BR）不敏感。遗传分析发现sdq 矮秆表型是由一对隐性基因控制的。进 一步通过图位克隆方法将SDQ 定位在第2 号染色体上InDel 标记Q14 和I2567之间，其物理距离 为99Kb。定位区间内共有 12 个预测基因。通过BSA 测序和定位区域的亲本间测序表明， Os02g0479700基因上sdq 存在拷贝数变异，另外在Os02g0480466和Os02g0480800 的基因间序 列上及Os02g0480800 内含子上各存在一个单碱基突变。 2. 从双矮秆地方品种特矮中分离得到1份携带sde(t)的半矮秆多分蘖材料新特矮，以高秆突 变体ZX5T 为轮回亲本，以新特矮为供体亲本，育成了携带sde(t)的ZX5T 近等基因系ZX5T-sde （以下简称sde）。与ZX5T 相比，sde 各节间均按比例缩短，表明sde 是 “dn”类型的矮秆突变 体。通过细胞学观察分析发现，sde 节间细胞数目极显著减少。外源激素处理实验表明sde 对GA3 和GR24 不敏感。遗传分析发现sde 半矮秆表型是由一对隐性基因控制的。基于sde/NJ6 的358 个F 隐性植株，将SDE 基因定位于第6 号染色体上的InDel 标记DE2 和dCAPS标记ME2 之间， 2 其物理距离为58Kb。定位区间内共有9个预测基因。通过BSA 测序和定位区域的亲本间测序表 明，在sde 和ZX5T 之间，只有Os06g0154200 的第一个外显子2102bp 处存在一个核苷酸替换（从 C 到T），导致第702 位精氨酸 （R）替换为色氨酸 （W）。RT-PCR 结果表明，该基因在sde茎 和穗部的表达显著增加。此外，Os06g0154200 已被报道为一种与独角金内酯相关的基因D3，其 突变体表现为多分蘖和矮化，与sde 相似。因此我们推测SDE 是多分蘖矮秆基因D3 的一个新的 弱等位基因。 3. 以高秆突变体ZX5T 为轮回亲本，以丛腊矮为供体亲本，育成了携带dn(t)的ZX5T 近等基 因系ZX5T-dn （以下简称dn），dn 平均株高为44.74cm，外源激素处理实验表明dn 对GA 敏感， 3 遗传分析表明dn 矮秆表型是由隐性基因控制的。通过基因初定位，初步将dn(t)基因定位在第3 号染色体上。 I 关键词：水稻 （OryzaSativaL.），株高，矮秆突变体，基因定位