基于Micro-CT的水稻茎部性状无损提取关键技术研究.pdfVIP

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基于Micro-CT 的水稻茎部性状无损提取关键技术研究 目 录 摘 要 i Abstract iv 1 绪论 1 1.1 研究背景 1 1.2 国内外研究现状与分析 3 1.3 主要研究内容与技术路线 6 1.3.1 主要研究内容 6 1.3.2 技术路线 7 2 基于水稻茎部的Micro-CT 成像系统设计 10 2.1 引言 10 2.2 Micro-CT 成像基本原理 10 2.2.1 X 射线成像的物理基础 10 2.2.2 Micro-CT 图像重建 13 2.3 Micro-CT 系统结构设计 15 2.3.1 X 射线源选型与评估 15 2.3.2 平板探测器选型与评估 17 2.3.3 Micro-CT 系统防护设计 20 2.3.4 Micro-CT 系统整体结构设计 21 2.4 Micro-CT 系统控制设计 23 2.4.1 X 射线源和平板探测器的控制 23 2.4.2 旋转载物台和RGB 相机的控制 25 2.4.3 图像采集模式的控制 26 2.5 Micro-CT 系统几何校准 29 2.6 Micro-CT 系统精度评估 31 2.7 本章小结 34 3 水稻分蘖性状提取分析与应用 35 3.1 引言 35 I 华中农业大学2019 届博士研究生学位论文 3.2 试验材料与试验设计35 3.2.1 试验材料35 3.2.2 试验设计37 3.3 水稻茎秆分蘖图像采集、图像处理和性状获取37 3.4 水稻茎秆分蘖与产量分析42 3.4.1 水稻茎秆分蘖的生长动态分析42 3.4.2 水稻茎秆分蘖生长和生物量预测44 3.4.3 水稻产量与干重早期预测46 3.4.4 水稻分蘖角度变化与产量的关系48 3.4.5 水稻无效分蘖对产量和抗旱的影响49 3.4.6 全基因组关联分析52 3.5 本章小结58 4 水稻茎秆性状提取分析与抗倒伏应用60 4.1 引言60 4.2 试验材料与试验设计60 4.3 水稻茎秆图像处理及性状获取61 4.3.1 SegNet 水稻茎秆分割62 4.3.2 SegNet 模型分割精度评估64 4.3.3 水稻茎秆分割图像流程68 4.4 水稻茎秆分蘖与抗倒伏分析70 4.4.1 水稻茎秆分蘖的Micro-CT 系统测量值与人工测量值对比70 4.4.2 弯曲应力建模72 4.4.3 弯曲应力与茎秆性状之间的关系74 4.4.4 基于CT 测量与RGB 测量水稻茎粗的比较75 4.4.5 弯曲应力对干重、秆密度及干旱相关性状的影响78 4.4.6 不同高度下茎秆面积分析79 4.4.7 分蘖期弯曲应力预测分析82 4.5 其他农作物茎部分析:以小麦为例86 4.5.1 试验材料与方法86 4.5.2 图像处理流程87 II 基于Micro-CT 的水稻茎部性状无损提取关键技术研究 4.5.3 小麦茎秆分蘖的Micro-CT 系统测量值与人工测量值对比 90 4.5.4 Micro-CT 系统与其他测量方法对比 91 4.6

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