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基于Micro-CT 的水稻茎部性状无损提取关键技术研究
目 录
摘 要 i
Abstract iv
1 绪论 1
1.1 研究背景 1
1.2 国内外研究现状与分析 3
1.3 主要研究内容与技术路线 6
1.3.1 主要研究内容 6
1.3.2 技术路线 7
2 基于水稻茎部的Micro-CT 成像系统设计 10
2.1 引言 10
2.2 Micro-CT 成像基本原理 10
2.2.1 X 射线成像的物理基础 10
2.2.2 Micro-CT 图像重建 13
2.3 Micro-CT 系统结构设计 15
2.3.1 X 射线源选型与评估 15
2.3.2 平板探测器选型与评估 17
2.3.3 Micro-CT 系统防护设计 20
2.3.4 Micro-CT 系统整体结构设计 21
2.4 Micro-CT 系统控制设计 23
2.4.1 X 射线源和平板探测器的控制 23
2.4.2 旋转载物台和RGB 相机的控制 25
2.4.3 图像采集模式的控制 26
2.5 Micro-CT 系统几何校准 29
2.6 Micro-CT 系统精度评估 31
2.7 本章小结 34
3 水稻分蘖性状提取分析与应用 35
3.1 引言 35
I
华中农业大学2019 届博士研究生学位论文
3.2 试验材料与试验设计35
3.2.1 试验材料35
3.2.2 试验设计37
3.3 水稻茎秆分蘖图像采集、图像处理和性状获取37
3.4 水稻茎秆分蘖与产量分析42
3.4.1 水稻茎秆分蘖的生长动态分析42
3.4.2 水稻茎秆分蘖生长和生物量预测44
3.4.3 水稻产量与干重早期预测46
3.4.4 水稻分蘖角度变化与产量的关系48
3.4.5 水稻无效分蘖对产量和抗旱的影响49
3.4.6 全基因组关联分析52
3.5 本章小结58
4 水稻茎秆性状提取分析与抗倒伏应用60
4.1 引言60
4.2 试验材料与试验设计60
4.3 水稻茎秆图像处理及性状获取61
4.3.1 SegNet 水稻茎秆分割62
4.3.2 SegNet 模型分割精度评估64
4.3.3 水稻茎秆分割图像流程68
4.4 水稻茎秆分蘖与抗倒伏分析70
4.4.1 水稻茎秆分蘖的Micro-CT 系统测量值与人工测量值对比70
4.4.2 弯曲应力建模72
4.4.3 弯曲应力与茎秆性状之间的关系74
4.4.4 基于CT 测量与RGB 测量水稻茎粗的比较75
4.4.5 弯曲应力对干重、秆密度及干旱相关性状的影响78
4.4.6 不同高度下茎秆面积分析79
4.4.7 分蘖期弯曲应力预测分析82
4.5 其他农作物茎部分析:以小麦为例86
4.5.1 试验材料与方法86
4.5.2 图像处理流程87
II
基于Micro-CT 的水稻茎部性状无损提取关键技术研究
4.5.3 小麦茎秆分蘖的Micro-CT 系统测量值与人工测量值对比 90
4.5.4 Micro-CT 系统与其他测量方法对比 91
4.6
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