黄河鲤新品系F3生长性能相关分子标记的鉴定与应用.pdfVIP

黄河鲤新品系F3生长性能相关分子标记的鉴定与应用.pdf

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华中农业大学2019 届博士研究生学位(毕业)论文 目录 目录 I 摘要i Abstracts iii 缩略语表vi 第一章 文献综述 1 1 黄河鲤及其选育研究进展 1 1.1 黄河鲤 1 1.2 黄河鲤选育进展 1 1.3 鲤选育技术研究进展2 1.3.1 以建立家系为基础的选择育种2 1.3.2 分子辅助选择3 1.3.3 转基因技术及染色体工程4 2 2b-RAD 技术用于鱼类育种的研究进展4 3 转录组在分子选育方面的研究进展5 3.1 转录组用于选育性状相关分子机制的研究5 3.2 转录组测序筛选营养物质介导的差异表达基因6 4 转录组测序技术在生长及脂代谢研究中的应用6 4.1 生长差异基因的筛选6 4.2 脂肪代谢差异表达基因的筛选7 5 本研究的目的与意义8 第二章 与体重相关分子标记的应用及其遗传效应分析 10 1 引言 10 2 材料与方法 11 2.1 实验材料 11 2.2 实验动物的养殖 11 2.3 分子标记的多态性检测 12 2.4 数据的统计分析 13 3 结果 13 3.1 多态性位点的筛选结果 13 3.2 HLJ13 、MFW4 、MFW7 、MFW 11、Koi42 、IGF2a4# 、IGF2R 第一内 含子、CO Ⅰ和D-Loop 基因生长优势基因型的富集性个体筛选 15 3.3 所筛选位点对体重的贡献率 16 3.4 所筛选分子标记的上位效应和遗传组分剖分 17 4 讨论 18 4.1 富集分子标记亲本的选择 18 4.2 不同位点间的上位效应 18 第三章 基于 2b-RAD 技术的黄河鲤新品系 F3 生长性能相关分子标记的筛选与 鉴定20 1 引言20 2 材料与方法21 I 黄河鲤新品系F3 生长性能相关分子标记的鉴定与应用 2.1 实验动物21 2.2 实验鱼养殖21 2.3 2b-RAD 测序、质量控制及数据处理22 2.4 QTL 分析23 2.5 Fst 分析23 3 结果24 3.1 构建的黄河鲤新品系家系及其生长性能与父母本的关系24 3.2 2b-RAD 方法分析亲本和子代的简化基因组SNPs 及其特点25 3.2.1 2b-RAD 方法分析获得所测个体的简化基因组SNPs 25 3.2.2 家系特异性分子标记、父本遗传标记、母本遗传标记28 3.2.3 与黄河鲤新品系生长优势传递的SNPs29 4 讨论36 4.1 黄河鲤新品系选育系和对照系生长性能的传递规律36 4.2 QTL 和Fst 联合分析获得黄河鲤生长性状有关的分子标记36 第四章 IGF2a 和IGF2b 基因的功能研究38 1 引言38 2 材料与方法39 2.1 实验鱼的养殖39

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