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苏云金芽胞杆菌H-抗原决定机制的研究
目录
摘要 i
ABSTRACT iv
缩略语表 viii
第一章 前言1
1.1 血清型及其在细菌分类研究中的应用1
1.1.1 血清型1
1.1.2 血清型在细菌分型中的应用1
1.2 鞭毛与H-血清型2
1.2.1 鞭毛的结构组成2
1.2.2 鞭毛蛋白与H-血清型的联系3
1.3 苏云金芽胞杆菌4
1.3.1 苏云金芽胞杆菌简介4
1.3.2 苏云金芽胞杆菌的Cry 分类5
1.3.3 苏云金芽胞杆菌的分子生物学分类5
1.3.4 苏云金芽胞杆菌的H-血清型分类6
1.3.5 苏云金芽胞杆菌鞭毛蛋白的种类及其与H-血清型的联系7
1.4 苏云金芽胞杆菌 H-血清型遗传决定因子研究的目的与意义9
第二章 材料与方法 11
2.1 实验材料 11
2.1.1 菌株 11
2.1.2 试剂和培养基12
2.2 实验方法13
2.2.1 鞭毛蛋白提取13
2.2.2 RT-PCR 14
2.2.3 质谱分析16
2.2.4 鞭毛合成基因簇分析17
2.2.5 鞭毛蛋白序列分析18
第三章 结果与分析19
3.1 蜡状芽胞杆菌群鞭毛合成基因簇具有丰富的多样性19
3.2 RT-PCR 分析转录水平上的差异22
3.3 蛋白质谱分析表达水平上的差异23
3.3.1 质谱确定鞭毛蛋白基因23
3.3 系统发育树分析25
3.4 翻译后修饰现象可能影响H 血清型27
3.4.1 血清型H3ac 、H3ad 、H3ade 、H9 和H10ab 的抗原决定因子分析29
3.4.2 血清型H4ab、H4ac 、H7 (4J5 )、H23 、H37 和H42 的抗原决定因子
分析32
3.4.3 血清型H5ab 和H7 (4J2 )的抗原决定因子分析35
3.4.4 血清型H8ac 、H8bd 、H20ab、H20ac 、H26 和H31 的抗原决定因子分
析36
3.4.5 血清型H1 、H27 和H28ac 的抗原决定因子分析40
3.4.6 血清型H25 和H41 的抗原决定因子分析42
苏云金芽胞杆菌H-抗原决定机制的研究
3.5 苏云金芽胞杆菌鞭毛蛋白糖基化岛分析44
第四章 总结与讨论46
4.1 蜡状芽胞杆菌和蕈状芽胞杆菌的鞭毛合成基因簇也存在着丰富的多样性..46
4.2 鞭毛合成基因簇及鞭毛蛋白基因的转录差异对Bt H-抗原的组成无直接影响
46
4.3 不同鞭毛蛋白的翻译差异影响Bt H-抗原的组成47
4.4 翻译后修饰现象对Bt 菌株的H-抗原组成起着关键性作用47
4.5 糖基化岛的有无与Bt 是否能够实现鞭毛蛋白的O-连接糖基化修饰过程无直
接联系48
附录54
附表S1 109 株苏云金芽胞杆菌鞭毛合成基因簇的结构类型54
附表S2 80 株蜡状芽胞杆菌鞭毛合成基因簇的结构类型57
附表S3 23 株蕈状芽胞杆菌鞭毛合成基因簇的结构类型59
附表S4 30 株Bt 鞭毛鞭毛蛋白质谱分析结果60
附表S5 不同血清型Bt 基因组中FGI 的有无71
致谢74
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