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信息生物学往年题库 海宁纸牌屋 PAGE2 ∏ NUMPAGES2 下列哪个句子最好的描述了两个序列全局比对和局部比对的不同： A. 全局比对通常用于比对DNA序列，而局部比对通常用于比对蛋白质序列 B. 全局比对允许间隙，而局部比对不允许 C. 全局比对寻找全局最大化，而局部比对寻找局部最大化 ■ 全局比对比对整体序列，而局部比对寻找最佳匹配子序列 假设你有两条远源相关蛋白质序列。为了比较它们，最好使用下列哪个BLOSUM和PAM矩阵： ■ BLOSUM45和PAM250 B. BLOSUM45和PAM 1 C. BLOSUM80和PAM250 D. BLOSUM10和PAM1 与PAM打分矩阵比较，BLOSUM打分矩阵的最大区别是： A. 最好用于比对相关性高的蛋白 B. 它是基于近相关蛋白的全局多序列比对 ■ 它是基于远相关蛋白的局部多序列比对 D. 它结合了全局比对和局部比对 如果有一段DNA序列，它可能编码多少种蛋白质序列： A. 1 B. 2 C. 3 ■. 6 要在数据库查询一段与某DNA序列编码蛋白质最相似的序列，应选择： A. blastn B. blastp C. tblastn D. tblastp ■ blastx 为什么ClustalW（一个采用了Feng-Doolittle渐进比对算法的程序）不报告E值： A. ClustalW报告E值 ■ 使用了全局比对 C. 使用了局部比对 D. 因为是多序列比对 Feng-Doolittle方法提出“一旦是空隙，永远是空隙”规则的依据是： A. 保证空隙不会引物序列加入而填充 B. 假定进化早期分歧的序列有较高优先级别 ■ 假定最近序列空隙应该保留 D. 假定最远序列空隙应该保留 根据分子钟假说： A. 所有蛋白质都保持一个相同的恒定进化速率 B. 所有蛋白质的进化速率都与化石记录相符合 C. 对于每一个给定的蛋白质，分子进化的速率是逐渐减慢的，就如同不准时的钟 ■ 对于每一个给定的蛋白质，其分子进化的速率在所有的进化分支上大致是恒定 系统发生树的两个特征是： A. 进化分支和进化节点 ■ 树的拓扑结构和分支长度 C. 进化分支和树根 D. 序列比对和引导检测方法 下列哪一个是基于字母特征的系统发生分析的算法： A. 邻位连接法（NJ法） B. Kimura算法 ■ 最大似然法（ML） D. 非加权平均法（UPGMA） 基于字母特征和基于距离的系统发生分析的算法的基本差异是： ■ 基于字母特征的算法没有定义分支序列的中间数据矩阵 B. 基于字母特征的算法可应用于DNA或者蛋白质序列，而基于距离仅能用于DNA C. 基于字母特征的算法无法运用简约算法 D. 基于字母特征的算法的进化分支与进化时间无关 一个操作分类单元（OTU）可指： A. 多序列比对 ■ 蛋白质序列C. 进化分支D. 进化节点 构建进化树最直接的错误来源是： ■多序列比对错误 B. 采样的算法差异 C. 假设进化分支是单一起源 D. 尝试推测基因的进化关系 第一个被完整测定的基因组序列是： A. 啤酒酵母的3号染色体 B. 流感病毒 ■ ФX174 D. 人类基因组 普通的真核生物线粒体基因组编码大约多少个蛋白质： ■ 10 B. 100 C. 1000 D. 10000 根据基因组序列预测蛋白质编码基因的算法的最大问题是： A. 软件太难使用 ■. 假阳性率太高，许多不是外显子的序列部分被错误指定 C. 假阳性率太高，许多不是外显子功能未知 D. 假阴性率太高，丢失太多外显子位点 HIV病毒亚型的系统演化研究可以： A. 证实HIV病毒是由牛病毒演化而来 ■. 用于指导开发针对保守蛋白的疫苗 C. 证实哪些人类组织最容易遭受病毒侵染 一个典型的细菌基因组大小约为多少bp： A. 20000 ■. 200000 C. 2000000 D.细菌基因组与真核生物基因组分析工具存在较大差异的主要原因是： A. 细菌拥有不同的密码子 B. 细菌没有细胞核 C. 细菌很少有基因与真核同源 ■细菌DNA的基因含量、组成结构很不一样 下列具有最小基因组的原核生物可能是： A. 嗜极生物 B. 病毒 ■ 胞内细菌 D. 杆菌 要证明某大肠杆菌中的某个基因是水平转移而来，需要： A. 分析该大肠杆菌中该基因的GC含量与其他基因是