【国自然】育与生殖相关的小分子化合物库及相关技术平台的建立.docxVIP

项目名称： 发育与生殖相关的小分子化合物库及相关技能渠道的树立 首席科学家： 谢欣 中国科学院上海生命科学研讨院 起止年限： 2009.1至2013.8 依托部分： 中国科学院 一、研讨内容 拟处理的要害问题： 跟着基因转染诱导体细胞重编程为干细胞的成功，干细胞研讨进入了一个新的阶段。可是选用化学生物学的战略，将小分子化合物用于干细胞的自我更新、定向分解以及体细胞重编程等方面的研讨却仅在近几年才刚刚起步。本项目拟环绕小分子化合物调控干细胞这一方针，处理如下科学问题： 能否使用小分子化合物坚持干细胞全能性、诱导干细胞定向分解及体细胞重编程？现在只要为数不多的小分子化合物被报导与坚持干细胞自我更新或促进定向分解相关，但这些化合物还不足以彻底代替培育基中的成长因子，且诱导分解的百分比也不能满意临床使用的需求。而在体细胞重编程研讨中，只要数个小分子化合物被报导能够增强转录因子诱导功率，但彻底代替转录因子的研讨还未有报导。能否使用小分子化合物坚持干细胞全能性、诱导干细胞定向分解及体细胞重编程是本项目拟处理的一个要害科学问题。要处理这个问题咱们需求树立具有必定结构多样性及靶标针对性的小分子化合物库及活络、安稳的活性判定和选择模型。 干细胞调控相关的小分子化合物库的树立。使用选择模型，经过对化合物库的高通量选择是取得具有生物活性的小分子化合物的有用途径。国内也有单位进行相似选择以取得小分子药物先导化合物。但现在国内的化合物库容量比较小，并且化合物选择也是随机进行，因而活性化合物的命中率十分低。崇高上现在已开宣布针对一类配体的化合物库，如针对G蛋白偶联受体、核受体、离子通道或激酶的化合物库，但针对干细胞调控的小分子化合物库没有报导。因而干细胞调控相关的小分子化合物的选择及库的树立也是本项目拟处理的一个要害科学问题。咱们将经过生物/化学信息学及核算生物学，树立虚拟选择渠道，选择或许与干细胞调控要害蛋白或通路有相互效果的小分子化合物或天然产品，用于活性研讨；另咱们也将树立组成渠道，对已有报导的或咱们选择发现的活性化合物进行结构改造和润饰，组成衍生物库，用于活性选择。经过化学与生物学的结合树立干细胞调控相关的小分子化合物库。 干细胞自我更新、定向分解及体细胞重编程模型的树立。有了具有必定结构多样性及靶标针对性的小分子化合物库，还必需树立活络、安稳的活性判定和选择模型，才干从库中发现具有干细胞调控活性的化合物。因而干细胞自我更新、定向分解及体细胞重编程模型的树立是本项目拟处理的另一个要害科学问题。咱们拟在已有的人、猴、小鼠胚胎干细胞系培育技能渠道根底上，使用形状、符号分子、干细胞多能因子Oct4/Nanog以及细胞的表观遗传润饰状况等方面的改变来归纳点评表达来点评干细胞的多能性或分解状况，然后树立活性判定模型。 首要研讨内容 树立生殖和发育相关特别是干细胞研讨相关的小分子化合物及天然化合物库，为相关范畴的科学家供给研讨及活性选择用的化合物资源： 经过文章、专利等检索搜集已有报导的、与干细胞诱导、增值及定向分解相关的小分子化合物信息，经过购买或组成搜集此类已有报导活性的化合物（70～100个），为科学家供给相关研讨的规范化合物； 经过对干细胞相关信号转导通路或其间重要蛋白质的核算生物学研讨及虚拟选择，选择并搜集或许具有干细胞调控功用的天然化合物，扩大化合物库，为进一步的活性判定试验供给资料； 选择、搜集具有结构新颖性及成药性的小分子化合物扩大化合物库，为进一步的活性判定试验供给资料； 使用网络和电子技能，树立我国干细胞相关化合物资源的中心数据库体系（包含网站、归纳数据库和多层多点的操作办理界面）以汇总和同享有关小分子化合物调控干细胞的信息；推行小分子化合物调控干细胞的常识、技能、操作经历等； 树立化合物库的办理运转规范、树立合理的化合物资源同享机制。 树立安稳的小分子化合物调控干细胞的活性判定和选择渠道，研讨小分子化合物在干细胞全能性坚持、定向分解及体细胞向干细胞重编程方面的功用； 树立坚持干细胞多能性小分子化合物的选择渠道：在已有的人、猴、小鼠胚胎干细胞系培育技能渠道根底上，按形状、外表分子SSEA和核内因子Oct4/Nanog的表达来点评干细胞的多能性状况，经过小分子化合物对干细胞短期和长时间培育的影响，来检测、验证其功用，隔阂检测它们对干细胞的毒性； 树立诱导干细胞定向分解的小分子化合物选择渠道：在已有的胚胎干细胞系培育和分解技能渠道根底上，参加小分子化合物与胚胎干细胞共培育，使用各种细胞的特定分子符号树立定向分解选择模型，从化合物库中选择出能促进或阻断定向分解进程的小分子化合物并以之为探针进行蛋白靶标判定和分解机制的研讨； 树立诱导iPS的小分子化合物选择渠道：咱们已使用反转录病毒导入了4个转录因子基因（Oct-4, Sox2, c-Myc和K