生物大分子的相互影响因素.pptVIP

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生物大分子的相互影响因素 生物大分子的相互影响因素 生物大分子的相互影响因素 第一节 概述 一、生物大分子的概念 生物大分子是由基本结构单位按一定的顺序以特定的化学键连接、聚合而成,发挥特定的生物学功能的大分子化合物。 分子量大小范围在104~106kD之间。 蛋白质、核酸和多糖均属生物大分子范畴。 生物大分子发挥生物学功能,执行表达、传递生物信息的三个条件:①分子结构 ②分子运动及变化 ③分子间的相互作用。 生物大分子的相互影响因素 生物大分子的分布:分布及其广泛,动物、植物和微生物界都有存在。 E.coli和哺乳类细胞分子组成 (占细胞质量百分比%) 成分 E.coli 哺乳类 水 70 70 无机盐(Na+,K+,Cl- 等) 1 1 各种小分子化合物 3 3 蛋白质 15 18 RNA 6 1.1 DNA 1 0.25 磷脂 2 3 其它脂 -- 2 多糖 2 2 生物大分子的相互影响因素 二、生物大分子相互作用的力 生物大分子之间的相互作用力是:非共价键作用。 非共价键的类型: ①离子键 ②氢键 ③van der Waals 力 ④疏水键 三、生物大分子的扩散与运动 ①扩散 ②运动 生物大分子的相互影响因素 四、分子相互作用的动力学 结合与解离 复合物中两分子结合愈强,解离反应的速率也就愈低。则两分子间的作用力就愈强。 平衡常数(亲和常数) A + B AB 平衡时有 Kon [A][B] = Koff [AB] [A] [B] Koff [AB] Kon 生物系统中简单的结合反应的亲和常数103~1012 L/mol 之间,相应的自能(又称结合能)在4~17 kcal /mol , 大约可产生4~17个氢键。 Kon Koff Keq (平衡常数) 结合速率=Kon [A][B] 解离速率=Koff [AB] 生物大分子的相互影响因素 第二节 蛋白质-蛋白质相互作用 一、蛋白质相互作用的结构基础 1、多肽链的折叠与装配: 伸展的多肽链必需形成特定的立体结构,或三维结构,才具有分子识别、结合及其它各种生物学功能。蛋白质的三维结构就是指多肽链在不同水平的折叠,即蛋白质折叠(protein folding)。伸展的多肽链通过内部规律性的氢键相互作用形成α螺旋和β片层,二或三个α螺旋和β片层组合成模序(motif),进而形成结构域(domain), 形成蛋白质的三级结构。 生物大分子的相互影响因素 2、蛋白质的模序(motif) : 在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个具有特殊功能的空间结构,被称为模序。 一个模序总有其特征性的氨基酸序列,并发挥特殊的功能。如α螺旋-环-

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