分子诊断学：基因组结构与特征-原核生物基因组.pptVIP

转座子的结构 复合转座子的结构 Tn1681 IS1 IS1 552bp IR IR IR IR 大肠杆菌热稳 定毒素I基因 1．引起突变 转位因子插入一个基因内部：插入失活； 转位因子插入多顺反子前端的基因中： 下游的所有基因停止转录（转位因子中含ρ依赖的转录终止信号 ）。 2．引入新的基因 如抗药性基因 3．引起生物进化 由于可导致基因重排，可能产生具有新的生物学功能的基因和新的蛋白质分子。 转座子的遗传效应 插入整合过程 转座整合过程 转座子引起的遗传变异 染色体内的异位交换 转座子介导的姊妹染色单体互换 染色体间的异位交换 逆转录子(retroposon) 又称逆转录转座子(retrotransposon)，通过DNA转录为mRNA后，再经逆转录成为cDNA并插入到基因组的新位点上的转座因子。 逆转录子可以分成两大类： LTR逆转座子 具有长末端重复序列(1ong terminal repeats，LTR)的转录子，这也是逆转录病毒基因组的特征性结构，这类逆转录转座子可以编码逆转录酶(Reverse transcripatase)或整合酶(integrases)，自主地进行转录，其转座机制同逆转录病毒相似，但不能像逆转录病毒那样以自由感染的方式进行传播。 非LTR逆转录子 包括LINES(长散在核元件)类、SINES(短散在核元件)类、复合SINE转座子类，其本身没有长末端重复序列，自身也没有转座酶或整合酶的编码能力，需要在细胞内已有的酶系统作用下进行转座。 逆转录子的共同特点，就是在其插入位点上产生短的同向重复序列(DR)。 逆转录子模型 逆转录子介导的基因重排 结果导致基因序列： 缺失 扩增 倒位 移位 断裂 中山大学肿瘤防治中心 SUN YAT-SEN UNIVERSITY CANCER CENTER 第三节 基因组结构与特征 基因组（genome）的概念 基因组指生物体一套完整的单倍体遗传信息，包括所有基因和基因间的区域。 原核生物和真核生物的基因组都是DNA，而病毒基因组是DNA或RNA。 原核生物和真核生物基因组又分染色体基因组与染色体外基因组，染色体外基因组指原核生物的质粒DNA、真核生物的线粒体DNA及叶绿体DNA。 每一种生物及其个体都有特定的基因组，携带构成和维持该生物体生命现象及其特征的所有遗传信息。 （一）原核生物基因组 原核生物基因组的结构 原核生物基因组的一般特征 一、原核生物基因组的结构 1. DNA分子量较小 大肠埃希菌基因组DNA:4.6×106 bp ,约3500个基因。 基因组DNA通常是由一条环状双链DNA（dsDNA）分子组成。 基因组中只有一个DNA复制起点。 基因组DNA位于细胞的中央区，与支架蛋白和RNA结合在一起，形成“类核”。 原核生物基因组类核结构（中央较致密的区域为类核） 2．存在操纵子结构（operon） 乳糖操纵子的作用机制 原核生物mRNA的结构特点 3 顺反子 顺反子 顺反子 插入顺序 插入顺序 先导区 (启动序列) 末端顺序 AGGAGGU SD区 一条mRNA链编码几种功能相关的蛋白质 3．结构基因多数是单拷贝，只有rRNA和tRNA是多拷贝。 结构基因中没有内含子成分 RNA合成后不需要剪切加工 基因之间也几乎没有间隔,结构基因之间不重叠。 基因之间存在重复序列，重复序列可形成茎环结构。 . 4．具有编码同工酶的不同基因。 基因表达产物的功能相同，但基因结构不完全相同。 5．GC含量差异大 有种属的特异性 6．非编码区内主要是一些调控序列 非编码区内存在多种功能的识别区域，存在反向重复序列，反向重复序列可形成特殊的结构，具有复制调控作用。 编码区所占比例为50﹪，小于病毒基因组，大于真核生物基因组。 7．存在着可移动的DNA序列 插入序列、转座子和质粒 等 重复序列 反向重复序列 在单链DNA或RNA中能形成茎环/发夹结构，在线状双链DNA中还能成十字形结构。 原核生物的类核（nucleoid）结构 类核中央部分由RNA和支架蛋白（scaffolding protein）组成，外围是双链闭环的超螺旋DNA。 超螺旋DNA一方面可附着在支架蛋白上形成多个DNA环；另一方面可与细胞膜相连接，使类核区域在菌体内相对固定，并参与DNA复制及转录。 原核细胞的组蛋白样蛋白质（hitone like proteins，HLPs）的功能与DNA的拓扑结构及基因表达有关。 大肠埃希菌基因组结构与功能 大肠埃希菌 ( E.coli )K12 菌株基因组图谱 质粒（ plasmid）） 特征