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分子量阵列基因分析仪的几个应用 摘要：分子量阵列基因分析仪已在科研实验上使用多年, 操作员积累了很多使用分子量阵列基因分析仪的经验和技巧, 这些实践经验和操作技巧的应用能够有效的提高分子量阵列基因分析仪的使用效率。本文主要探讨了分子量阵列基因分析仪的几个应用, 这些操作技巧的应用能使分子量阵列基因分析仪操作更加简单, 有效。 Sequenom公司研发的分子量阵列基因分析仪已在市场上使用多年, 在使用仪器的过程中, 仪器操作员积累了大量操作经验和技巧, 这些操作经验和技巧的应用可以提高操作员的工作效率, 使得操作员的工作更加轻松, 文章中将就Sequenom公司研发的分子量阵列基因分析仪的几个操作技巧进行探讨。在文章中仪器型号为Mass ARRY Analyzer 4, 所使用的软件版本为typer4.0。1 点样Mass ARRY Analyzer 4分为两部分组成, 分别是点样仪和质谱仪, 点样仪的作用就是把前期处理好的样品转移到芯片上, 然后在把芯片放入质谱仪里面通过扫描而得到实验数据。1.1 清洗点样仪由于点样仪所使用的点样针是固定的, 所以为了保持它的清洁, 我们要对它进行清洗工作, 清洗工作分周洗和日洗, 周洗就是每周一次把点样针浸泡在Na OH中, 日洗就是在每日使用前需要用100%乙醇浸泡点样针。具体操作如下:打开点样仪, 输入用户名和密码, 进入主页—TOOLS—SOLUTION (Drain排空机器剩余乙醇) —SOLU-TION (Fill移动点样针) , 把仪器上的乙醇瓶取出倒入100%乙醇并放入仪器, 取出新的384孔板, 在板子的A1到A6, B1到B6, C1到C6, D1到D6, 24个孔中加入Na OH, 并把板子固定在MTP1位置。再次进入主页—TOOLS—WEEKLY, 这时仪器就会把点样针浸泡入刚放Na OH的384孔板中进行周洗, 此过程需要10分钟, 周洗结束后显示屏界面依旧停留在TOOLS界面, 选择DAI-LY, 这时仪器就会把点样针浸泡入乙醇中进行日洗, 此过程需要30分钟。清洗结束后我们依然在TOOLS界面点击SOLU-TION (Drain排空机器剩余乙醇) —SOLUTION (Fill移动点样针) , 取出乙醇瓶倒入50%乙醇并放入仪器。注意:点样过程中清洗点样针的乙醇浓度和日洗的乙醇浓度是不一样的。1.2 点样位置的设置取出新的芯片放到Scout Plate位置, 把处理好的样品板放到MTP1位置, 取30ul标准品加入仪器的标样收集孔里。回到显示屏主页→MAPPING→选384 MTP→next→选24 PIMS→next→选384 SPECTROCHIPS→netx→选1→next→MTPs1→next, 此时就根据实际情况选择芯片与样品板之间的位置, 选完之后点save, 在弹的对话框Type Mapping Filename中输入要取的名字, 如“1”。1.3 仪器点样参数的设置再次回到显示屏主页→METHODS, 在Mapping File这里点OPEN, 弹出的对话框选择“1”即刚刚建立的Type Mapping Filename, Analysis这栏选volume check, Spectro CHIPs选1。在页面最下方点击cleaning, 进入cleaning界面, Cleaning Sequence栏里rinse, dry (rinse) , wash, dry (wash) , 4个选项都选上。页面下方点击aspirate/dispense, operation栏里选择analytecalibrant, Save-back。1.4 点样操作显示屏主页→TRANSFER, 点击屏幕右上方的open, 选择“1”→ok, 点击右下方的step, 此时点样针会把样品点到芯片上一次, 然后我们可以根据点样针上方自带的摄像头看到点样量的大小, 点样量的大小可以根据在METHODS→aspirate/dispense页面里的dispense settings拦下dispense speed数值大小调节。数值越大, 点样量越大, 反之越小。点样量没问题后就在TRANSFER界面上直接点右下方的run就可以完成全部点样操作了。2 质谱仪的使用 (1) 打开连接质谱仪的电脑, 点击star→All Programs→Sequenom→Typer 4.0.20→Typer 4.0.20, 此时弹出Mass AR-RAY Typer对话框, 点击Assay Editor输入服务器名称, 用户名和密码, 单击Connect。在出现的对话框里导入所做实验的位点信息。 (2) 在Mass ARRAY Typ