一种用于丙肝病毒分型和耐药位点检测的探针和方法发明专利.pdfVIP

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 108018376 A (43)申请公布日 2018.05.11 (21)申请号 201610929662.6 (22)申请日 2016.10.31 (71)申请人 深圳华大基因股份有限公司 地址 518083 广东省深圳市盐田区洪安三 街21号华大综合园7栋7层-14层 (72)发明人 钟宏彬　朱小龙　姚秋林　汪智蛟　 陈俊清　刘娜　 (74)专利代理机构 深圳鼎合诚知识产权代理有 限公司 44281 代理人 孙银行　彭家恩 (51)Int.Cl. C12Q 1/70(2006.01) C12Q 1/686(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C40B 40/06(2006.01) 权利要求书1页 说明书15页 序列表4页 (54)发明名称 一种用于丙肝病毒分型和耐药位点检测的 探针和方法 (57)摘要 本发明公开了一种用于丙肝病毒分型和耐 药位点检测的探针和方法。本发明的探针的核苷 酸序列如SEQ ID NO：1-17所示。本发明提供的探 针能够用于丙肝病毒分型和耐药位点检测，并且 可用于多种(总数量46种)HCV病毒亚型的分型 以及耐药位点检测，可有效地筛选合适的药物， 避免使用已免疫的药物，做到个性化治疗。 A 6 7 3 8 1 0 8 0 1 N C CN 108018376 A 权　利　要　求　书 1/1页 1.一种用于丙肝病毒分型和耐药位点检测的探针，其特征在于，所述探针的核苷酸序 列如SEQ  ID NO：1-17所示。 2.一种用于丙肝病毒分型和耐药位点检测的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括探 针，所述探针的核苷酸序列如SEQ  ID NO：1-17所示。 3.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括：用于提取丙肝病毒 RNA的试剂成分。 4.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括：用于反转录丙肝病 毒RNA的试剂成分。 5.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括：用于对丙肝病毒RNA 反转录后得到的cDNA进行文库构建的成分。 6.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于，所述对cDNA进行文库构建的成分包括： 用于末端修复的成分，用于3’末端加A碱基的成分，用于接头连接的成分，用于PCR扩增的成 分。 7.根据权利要求5或6所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括：用于文库捕获的 成分。 8.一种用于丙肝病毒分型和耐药位点检测的基因芯片，其特征在于，所述基因芯片包 括固体载体和探针，所述探针的核苷酸序列如SEQ  ID NO：1-17所示。 9.一种用于丙肝病毒分型的方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤： 核酸的提取与处理：对全血或分离后的血浆样本，采用RNA病毒提取试剂进行病毒RNA 的提取；然后进行反转录将RNA合成为双链cDNA； 文库的构建：对上述获得的双链cDNA进行文库的构建； 文库捕获：使用核苷酸序列如SEQ  ID NO：1-17所示的捕获探针对构建好的文库进行杂 交捕获； 测序：对捕获后的文库，进行高通量测序； 信息分析：对获得的原始下机数据进行人源序列的去除，然后与现有的HCV参考序列进 行比