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试验一 哺乳动物细胞总 RNA 的提取,电泳(定量)
试验二 反转录 -聚合酶链式反应 ( RT-PCR) 试验三 DNA 的琼脂糖凝胶电泳
试验一 哺乳动物细胞总 RNA 的提取,电泳
一,试验目的
学习并把握总 RNA 的分别提取,检测质量以及定量的方法;二, 试验原理
细菌的总 RNA 主要由 rRNA ,tRNA 及 mRNA 组成,其中 rRNA 含量最多 (占 80%~85 %);
在 pH 6.0 微酸环境下, RNA 相对稳固,碱性环境下,易分解;
验成败的关键;RNA 的产量取决于组织或细胞的来源,但是,通常每毫克组织可获得4~7 μ g RNA ,每 106细胞可获得 5~10 μ g RNA ,提取的RNA A 260 /A
验成败的关键;
RNA 的产量取决于组织或细胞的来源,但是,通常每毫克组织可获得
4~7 μ g RNA ,每 106
细胞可获得 5~10 μ g RNA ,提取的
RNA A 260 /A 280 比值一般为
1.8~2.0 ;
在 RNA 相关试验过程中,须树立
RNase-free 思想: 1)样品新奇,储存得当,以强变性剂,
防止内源性 RNase; 2)人体上遍布 RNase,养成操作时勤换一次性手套和口罩的好习惯;
3)空
气中灰尘和细菌含 RNase,应建立洁净的操作环境;
试验介绍如何使用 TRIzol 来分别总 RNA ; TRIzol 是一种酸性苯酚提取试剂,含有去垢剂,
和使 RNase 失活的异硫氰酸胍, 它能在破裂和溶解细胞时保持 RNA 的完整性, 防止 RNA 降解;
(留意: TRIzol 具有剧烈腐蚀作用,当心操作; ) 三,试验材料,试剂与器材
1,细胞( 5х 106Hela)
2,DEPC 水溶液, PBS, TAE
3,氯仿,异丙醇,乙醇均为分析纯4,TRIzol 试剂购自 Invitrogen
5,烧杯( 1000 , 500, 100, 50ml 如干),量筒( 1000, 500 , 250, 50 , 20 ml 如干),玻璃
棒,药勺,试剂瓶,三角瓶;枪头( 1000 ,200,20 ul ),离心管 (0.2ml ,0.5ml PCR 管 ,1.5ml , 2ml ,7ml 离心管 ),枪头盒;
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四,试验步骤
RNA 提取前的预备
,玻璃器皿,金属及耐 250℃物品的处理:
于高温烘箱中干烤, 180 ℃, 5 小时,干烤前均用锡箔纸密封器皿头部;
,塑料制品的处理:
0.05-0.1% 的 DEPC (焦碳酸二乙酯水)浸泡过夜:
必需保证塑料制品被水浸透,内部没有气泡,对于小枪头, 0.2ml ,0.5ml PCR 管,必要时应用枪逐个的用水灌注(这一步对于以后的试验保证特别重要,须当心操作) ;
泡过夜后,用镊子逐个敲去管内的 DEPC 水,装于干烤过的烧杯,加锡箔纸密封杯口;尽量敲去枪头内的水,装于处理过的枪头盒,报纸包好;
121℃,30 分钟高压灭菌, 以排除残存的 DEPC ,否就 DEPC 也能和腺嘌呤作用而破坏 mRNA
活性,且抑制后继酶促反应,烘干,备用;
DEPC 是蛋白质强变性剂 ,它和 RNA 酶的活性基团组氨酸的咪唑环反应而抑制酶活性; 具 强挥发性,致癌物 ,因而使用时应在通风橱操作,需戴一次性手套,一次性口罩,当心操作;
,试剂的配制:
试验所用试剂也可用 DEPC 处理过夜, 再高压灭菌 ,但 DEPC 能与胺和巯基反应 ,因而含 Tris 和 DTT 的试剂不能用 DEPC 处理,可用 DEPC 处理的水配制, 并尽可能用未曾开封的试剂, 然后高压灭菌;
所需烧杯等必需干烤处理以后方可用;
0.05-0.1 ‰的 DEPC 水(三蒸水) ,磁力搅拌器搅拌过夜或者摇床低速振荡过夜, 121℃, 30
分钟高压灭菌;
RNA 的提取 (TRIzol 法):
安全去除细胞生长介质
往细胞培育瓶中加入 1ml PBS 洗涤单层细胞,不要将细胞破裂,倒出 PBS 洗涤液
向细胞培育瓶中加入 2mlTRIzol ,以枪当心吹打,分入 2 个 1.5mlEP 管中
室温下培育五分钟(使核蛋白复合物充分分别)时间可能更长 30min
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向 EP 管中加入 0.2ml 氯仿/1mlTRIzol ,用力摇动 15 秒钟,室温培育三分钟
12000g,4o C 离心 15min
当心吸取上层无色水样层( 0.6ml/mlTRIzol )转移至一新 EP 管中
加入 0.5ml/mlTRIzol 异丙醇,室温放置 15min
12000g,4o C
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