一种用于新型冠状病毒感染患者无创诊断的口腔微生物基因标志物及其应用发明专利.pdfVIP

一种用于新型冠状病毒感染患者无创诊断的口腔微生物基因标志物及其应用 技术领域 本发明属于生物医药技术领域，具体涉及一种用于新型冠状病毒感染患者无 创诊断的口腔微生物基因标志物及其应用。 背景技术 新冠肺炎的广泛传播给全世界的卫生健康事业带来了极大的负担。通过逆转 录聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)进行核酸 检测来判断是否感染新型冠状病毒(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2，SARS-CoV-2)，是目前公认的诊断“金标准”。但是，由于病毒窗口 期等方面的原因，感染新冠病毒后，部分患者经 RT-PCR 检测出现假阴性的结果， 且假阴性率高达20％，这极大的增加了疾病的传染源和传播范围。因此，建立 一种新的区别健康人和新型冠状病毒感染者的诊断模型，以弥补现有检测方法的 不足，对于新冠肺炎防治工作具有重大意义。 正常人体寄居的细菌种类超过1000 种，数量高达100 万亿。这些数量庞大 的微生物和人体内环境相互作用，共同构成了人体微生态系统。口腔微生态系统 作为消化系统的起始端，是人体微生态系统的重要组成部分，与人体健康和疾病 密切相关。目前从口腔中分离和鉴定出来的细菌种类已经达到700 余种。口腔菌 群和宿主共生并共进化过程中，在调节宿主的消化吸收、免疫反应、代谢、炎症 等方面发挥重要作用。口腔微生态失调促进慢性疾病、系统性疾病的发生发展， 包括龋齿、类风湿性关节炎、心血管疾病、结肠癌、颈部鳞状细胞癌等。 口腔微生物中关健功能菌可成为人类疾病的新型生物标志物。口腔微生态的 特征或者基于口腔微生物建立的区别模型作为特定疾病或肿瘤的区分工具正越 来越多被广泛报道和认可。口腔菌群可反映人对疾病的易感性，提示口腔菌群具 有潜在的预警和诊断作用。Burkhardt F 等(Gut，2017 年)通过宏基因组学报道了 口腔微生态与结直肠癌的相关性，指出16 个菌种可能成为区分结直肠癌的口腔 微生物标志物。Zhang X 等(Nature Medicine,2015 年)通过宏基因组测序技术解析 了中国人群类风湿性关节炎患者的口腔微生态结果，在微生物基因和功能水平 上，鉴定了类风湿性特异性的6 个牙齿微生物标志物和2 个唾液微生物标志物， 创建了两个高准确度的类风湿性关节炎患者区分模型。Yang L 等指出，口腔微生 态的改变与艾滋病毒感染者的肺部功能损害及系统炎症密切相关。口腔微生物可 以作为预测艾滋病感染者肺功能的标志物，并且口腔微环境稳态的破坏有助于慢 性阻塞性肺疾病的病理发展。Richard B 等(JAMA Oncology，2018)等指出口腔中共 生Corynebacterium 和Kingella 的丰度越高，头颈部鳞状细胞癌的风险就越低， 这对癌症的预防有潜在的意义。FarrellJ 等(Gut，2012) 揭示了胰腺癌患者的口腔 微生态特征，并鉴定出胰腺癌患者的2 个口腔微生物标志物，建立了一个高准确 度的胰腺癌患者区分模型。因而，口腔微生物可能是不同疾病诊断的有力工具。 然而，用于区别新型冠状病毒感染和非感染者的口腔微生物模型还未曾报道过。 发明内容 本发明提供了一种用于区别新型冠状病毒感染和非感染者的口腔微生物模 型，由SEQ ID NO:1-8 所示的8 种微生物基因组成，所述微生物基因在人体口腔 中富集。 另外本发明还提供了一种用于检测试剂，包括用于检测SEQ ID NO:1-8 所示的 8 种微生物基因的引物，序列如下： OTU1721 CCTACGGGTGGCAGCAGTGAGGAATCTTCCACAATGGGCGAAAGCCTGATGGAGCAA CGCCGCGTGCAGGATGAA GGCCTTCGGGTTGTAAACTGCTTTTATAAGTGAGGATTATGACAGTAACTTATGAATAAGGA TCGGCTAACTACGTGCC AGCAGCCGCGGTCATACGTAGGATCCGAGCGTTATCCGGAGTGACTGGGCGTAAAGAGTT GCGTAGGTGGTTCGATAAG CGAATAGTGAAATCTGGTGGCTCAACCATTCAGACTATTATTCGAACTGTTGAACTCGAGAG CAGAAGAGGTAGCTGGA ATTTCTAGTGTAGGAGTGAAATCCGTAGATATTAGAAGGAACACCGATGGCGTAGG