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第六章 蛋白质生物合成;翻译:RNA参与蛋白质生物合成,将核苷酸序列转变为氨基酸序列的过程。;蛋白质合成的场所是:
蛋白质合成的模板是:
模板与氨基酸之间的接合体是:
蛋白质合成的原料是:
;;第一节 遗传密码;1 遗传密码
遗传密码(genetic code): mRNA中蕴藏遗传信息的碱基顺序。
密码子(codon) :mRNA中每个相邻的三个核苷酸的三联体。
为什么是三联体密码子?;遗传密码的破译;柯拉那(美国)Har Gobind Khorana,1922~ ;;2 遗传密码的特点 ;2 遗传密码的特点:
(1)起始码与终止码:
AUG是起始密码,多肽链合成的第一个氨基酸都是蛋氨酸;
少数细菌也用GUG做为起始码。
真核生物偶尔也用CUG作起始密码。
UAA,UAG,UGA是终止密码,无意义密码子。
翻译是沿着mRNA分子5′→3′方向进行的。;(2)密码无标点符号:
两个密码子之间没有任何核苷酸隔开。;(3)简并性:
几组密码子代表一种氨基酸的现象。
同义密码子。
密码子的简并性主要是由于密码子的第三个碱基发生摆动现象形成的,也就是说密码子的专一性主要由前两个碱基决定。
除AUG(Met)和UGG(Try) 外,每个氨基酸都有一个以上的密码子;
简并密码子使用的频率并不相等。;(4)密码的通用性:
密码表是生物界通用的。
具有四大生物系统(病毒、细菌、动植物)的通用性和保守性(Mt除外)。;;tRNA反密码子第一个碱基;; 第二节 tRNA的功能1 tRNA的结构2 tRNA的功能3 tRNA对氨基酸的识别 4 tRNA的种类;1 tRNA的结构; 1.1 tRNA的空间结构 ; b、TψC臂
特殊的碱基ψ(假尿嘧啶),5bp茎环的配对
功能:负责和核糖体上的rRNA 识别结合;
c、 反密码子臂
5bp茎环的配对, 反密码子
功能:负责对mRNA上的密码子的识别与配对。
d、D环
茎区常为4bp,含有特殊的碱基D(双氢尿嘧啶)
功能:起连接作用
e、额外环
可变性大,从4 Nt到21 Nt不等,
功能:在tRNA三维结构中连接两个区域(D环-反密码子 环和TψC-受体臂)。;TψC环;(2) “ L”形三级结构
三叶草型的二级结构可折叠成倒L型的三维结构。;;; 第二节 tRNA的功能1 tRNA的结构2 tRNA的功能3 tRNA对氨基酸的识别 4 tRNA的种类;2 tRNA的功能;; 第二节 tRNA的功能1 tRNA的结构2 tRNA的功能3 tRNA对氨基酸的识别4 tRNA的种类;tRNA怎样接受特定的氨基酸?
氨基酰-tRNA合成酶(AARS)
蛋白质合成的真实性主要决定于AARS是否能使氨基酸与对应的tRNA相结合。
氨基酰-tRNA合成酶(AARS)怎样识别tRNA?
tRNA中的哪些结构和接受特定氨基酸有关?;3.1 AA– tRNA合成酶(AARS )
★模板mRNA只能识别特异的tRNA而不是AA。
★氨基酸进入蛋白质合成途径是通过氨基酰-tRNA合成酶(AARS) ,这种酶将氨基酸和特异的tRNA连接起来,成为氨基酰tRNA 。
Prok中AARS有20种,对AA及tRNA高度专一,准确结合;
★ 大小:40kDa~100kDa之间,有单聚体、二聚体和四聚体。 ;★ 需要三种底物 AA tRNA ATP
★ 因此有三个位点
aa binding site
tRNA binding site
ATP site ;;;AARS 上有四种活性区域:
催化区域: ATP和氨基酸结合位点
tRNA接受臂螺旋结合区域
tRNA反密码子结合区域
聚合区域(II类没有聚合);(4) 两类酶与tRNA反应时--接近模式不同;I类和II类合成酶与tRNA的相互作用有所区别。经晶体结构分析,两类酶与tRNA接触的方位正好相反,;;3.2 tRNA上与接受特定氨基酸有关的结构; 第二节 tRNA的功能1 tRNA的结构2 tRNA的功能3 tRNA对氨基酸的识别4 tRNA的种类;4 tRNA的种类;4 tRNA的种类;4.2 同工tRNA(isoaccepting tRNAs)
携带AA相同而反密码子不同的一组tRNA;
不同的反密码子识别AA的同义密码;
同功tRNA在细胞内合成量
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