蛋白质模拟与药物设计.pptVIP

* Box and Grid 第二十七页，共61页。 * 第二十八页，共61页。 * Probe Atom or Groupelectronic atom, ion or molecule with certain volume H2O Water, the Hydrophobic Probe H+ Electrostatic interaction CH3 Steric interaction C+ sp3 Electrostatic Steric interaction O:: sp2 carboxy oxygen atom N:= sp2 N with lone pair N3+ sp3 amine NH3 cation O- sp2 phenolate oxygen 第二十九页，共61页。 * Box and Grid pKi = B(D1) + C(D2) + + ... A PLS: 第三十页，共61页。 * Steric CoMFA Contour Map 第三十一页，共61页。 * Electrostatic CoMFA Contour Map 第三十二页，共61页。 * Exp. Pred. 第三十三页，共61页。 Receptor-based drug desig