从质谱数据鉴定多肽蛋白质.pptVIP

肽键断裂的说明 CID中，肽键的断裂方式有非常多的可能性。关于具体的断裂方式，可以去查询生物化学方面的书籍。这些问题超过了本课程的范围。 通常，我们只考虑b系列和y系列。原因是我们使用的电压较低，其他系列的离子不易产生。 但实际上，如果能够清楚的知道我们究竟需要考虑什么样的断裂方式，对搜索算法的设计会有很大的帮助。 第三十页，共64页 通过残基鉴定多肽 第三十一页，共64页 De-novo Sequencing 这种通过残基来鉴定多肽的方法被称为De-novo Sequencing。 当我们拥有近乎完美的二级质谱图时，我们可以采用这种De-novo Sequencing的办法。 但是，实际情况中，我们并没有完美的二级质谱图，而一点点的不完美，带来的误差是惊人的。 第三十二页，共64页 氨基酸质量表 Molecular weights used for calculations. Buttoncode Shortcode Name Average massof residue Monoisotopic?mass of residue Twenty Naturally-Occurring Amino Acids Ala A Alanine 71.0788 71.03711 Cys C Cysteine 103.1448 103.00919 As