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一、仪器结构：
GC-MS组成：
GC ：填充柱 毛细管柱均可
MS ：常用四极杆质谱仪，近来还有离子阱和飞行时间质谱仪
接口：填充柱——须用分子分离器
毛细管柱——直接插入质谱仪的离子源
数据系统：计算机 数据库
气质联用系统提供的信息：
GC-MS-Computer的工作过程：
GC：各组分被色谱柱分离，随时间变化依次从柱子流出，通过接口进入MS。
MS：连续扫描MS图，每扫描一张MS图需花费约零点几到几秒钟。总扫描时间＝(扫一张图谱的时间)×扫描次数
计算机：将得到的所有MS数据存储起来，供下一步的处理和输出。
总离子流图（TIC）
质谱仪检测到的所有离子信号（不分其质荷比）的总和对时间t作图，相当于气相色谱图。 没有组分通过时为基线；当组分流出时，即出现峰。
记录方法：TIC检测器；
计算机采集和存储连续、重复扫描的信息，然后进行数据处理。
每个组分的质谱图：
可从质谱图获得组分的分子量和分子结构信息。
质量色谱图（提取离子流图）
以指定质荷比的离子强度（而不是总的离子流强度）对时间t（或扫描号）作图。
是计算机进行数据处理得到的图。
优点：可在复杂混合物的TIC图中,迅速找到所需检测的化合物或同系物。
二、GC-MS的应用：
凡是能用气相色谱分析的试样，均适合于 GC-MS分析，如
环境污染物的分析
香精、香料的成分分析和质量评价
中草药的挥发性成分鉴定
药物及其他化工产品的分析
毒物、毒品及违禁药物的鉴定和检测等等。
GC-MS定性分析
分析条件的设定：GC条件：同普通GC。MS条件：扫描方式，扫描范围， 扫描速度, 灯丝电流，倍增器电压等
定性分析：进样，电离，质谱数据的采集，谱图检索
GC-MS定量分析
GC-MS定量分析依据：1、用总离子色谱图定量2、用质量色谱图（提取离子色谱图）定量3、用选择离子色谱图定量（SIM，选择离子监测）
GC-MS定量分析方法：外标法，内标法。
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