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1;2;3;控制金属离子对蛋白质位置的选择和插入的因素：;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20;21;22;23;1) 共价键作用：;2)非共价作用：;沟面结合（groove binding）：DNA存在大沟和小沟两个区域，在电势能，氢键特征，立体效应，水合作用上有很大不同。 蛋白质分子与DNA的结合在大沟区域。 小分子配合物一般在小沟区域与DNA结合。 一些小分子由于自身的立体构型，能够在两个区域内通过氢键或疏水作用与DNA结合。如： [Co(NH3)6]3+ 通过配体NH3的氢原子与ＤＮＡ磷酸上的氧原子和鸟嘌呤的氮原子形成氢键而结合；［Ｃｕ（ｄｍｐ）２］２＋则通过ｄｍｐ（2，9-二甲基1，10-邻菲罗林）配体依靠疏水作用嵌在ＤＮＡ的小沟处。;插入结合（intercalation): 是金属配合物与DNA作用最重要的一种方式。含有平面芳香稠环结构的饱和配合物以平面芳香杂环配体插入DNA，并与DNA中的碱基对重叠，以氢键，范德华力和大环的?-?堆积作用而稳定。;28;29;30;31;32;33;34;8.3b 金属配合物与核酸作用的应用;某些金属配合物对RNA的结构有特定选择性，如对于tRNAPhe的断裂研究中，用MPE-Fe（II）（MPE= methidiumpropyl-EDTA)能区分出RNA的双螺旋区；[Cu(phen)2}+ 识别环上的凸处的单链区。;DNA特殊结构的识别。 DNA的结构除了双螺旋外，还具有一些特殊的结构：;Meso-[{Ru(phen)2}2(HAT)]4+ (hat = 1,4,5,8,9,12-hexaazatriphenylene) 对DNA发夹结构的结合显著强于对正常DNA的结合能力，可作为DNA发夹结构的探针。;39;40;41;2. 分子光开关及比色传感器;比色传感器是与生物分子直接或间接作用之后，呈现裸眼可视的颜色变化的仪器，因此可以很直观的判断生物分子的存在或构象。例如： 钌配合物[{(bpy)2Ru}2(4-azo)]4+ 与ＤＮＡ在富含Ａ／Ｔ序列碱基的小沟结合；在配合物中加入ｐｏｌｙ　ｄ（Ｇ）－ｐｏｌｙ　ｄ（Ｃ）时溶液颜色没有变化，而加入双链ＣＴ－ＤＮＡ或ｐｏｌｙ　ｄ（Ａ）－ｐｏｌｙ　ｄ（Ｔ）后，颜色发生明显变化。;3. 化学核酸酶;１）化学核酸酶的组成;２）化学核酸酶的作用方式：;金属离子与H2O2反应,生成羟基自由基OH?，OH?进攻糖环上的C4’位置，断裂核酸链，生成5’-磷酸酯，3’-磷酸酯及磷酸甘油酯的混合物与碱基丙烯醛混合物。;48;b)水解反应：研究发现，金属离子的存在能有效地促进DNA和RNA的磷酸二酯键的水解，它们作为Lewis酸极化磷-氧键并促进其断裂，还可以运送亲核试剂，形成五配位的磷酸基中间物。例如：;在离子Cu(II), Co(II), Zn(II), Cd(II), Pb(II)的存在下，[Ru(dip)2Macro]2+ 可以与DNA的每条链反应水解断裂DNA。;水解类断裂试剂相比于自由基类切割试剂而言，具有很多优点：1）生成的碎片具有3’- 或5’-磷酸末端，且碱基和糖环未被破坏；2）这类试剂不易产生易扩散的自由基，利于合成高度序列专一性的定点切割试剂；3）不需要氧化还原性的辅助因子，对生物体的毒害作用较小。 近年来有关双核金属离子配合物切割核酸的报道越来越多。目前有关Zn（II），Fe（II），Cu（II），Co（III）和三价镧系离子的双核配合物切割核酸的研究表明，双核配合物的催化性能比相应的单核配合物高很多。;52;53;54;55;56;57;58;59;60;61;62