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多聚酶链式反响(PCR)扩增DNA片段及琼脂糖凝胶电泳产物检测
一、实验目的:
1、认识PCR技术的基本操作
2、理解PCR的原理
3、议论PCR的应用
二、实验原理:
PCR是一种在体外模拟细胞内环境进行快速扩增DNA片段的技术,这一技术需要模板、
四种脱氧核苷酸等组分条件外,还需要不同温度环境以进行DNA的解旋和聚
1、PCR反响组分
细胞内DNA复制条件剖析:
条件
在DNA复制中
实验条件/材
参与的组分
料
的作用
模板
提供复制的模
模板DNA
DNA的两条单链
板
原料
合成DNA子链
dNTPmixture
四种脱氧核苷酸
的原料
酶
催化合成DNA
TaqDNA聚合
DNA聚合酶
酶
子链
酶
解旋酶
翻开DNA双链
温度控制
为DNA聚合酶
引物I
引物
引物
一小段单链DNA
或RNA
提供合成的3’端
II
起点
别的,试验中用到的还有
Mgcl2,Mg2+能激活酶的活性;
10*Buffer
缓冲液,为
Taq酶提供合适的
PH条件。
2、PCR反响条件
1
PCR利用了DNA的热变性原理,经过控制温度来控制双链的解聚与联合,现在使用的PCR仪实质上也是一台能够自动调控温度的仪器。
PCR一般经历三十多次循环,每次循环能够分为三个基本步骤──变性、复性和延长。
(!)变性(模板DNA解旋)
模板DNA经加热至90℃以上。一准时间后,使模板DNA双链解离,使成为单链,以便于它与引物联合,为下轮反响作准备。
(2)复性(退火)
模板DNA经加热变性成单链后,温度降到50℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对联合。
延长
DNA模板-引物联合物在TaqDNA聚合酶的作用下以脱氧核苷酸为原料,以母链为模板,
按碱基互补配对的原则与半保存复制的原理,合成一条新的DNA链。
循环数
变性
复性
延长
第一次(预变
94°C,
-
-
性)
30s
30次94℃,52℃,72℃,20s
20s20s
最后一次(保
72℃,30s
温)
3、PCR产物的检测
紫外分光光度计
DNA在260nm的紫外波段有一强烈的吸收峰,能够经过与蒸馏水的对照进而计算扩增出DNA的含量。
(2)琼脂糖凝胶电泳
DNA在电厂作用下,能够由电源的负极向正极泳动,泳动的速度与DNA片段的长度成负
有关,与电压强度成正比,因此能够分别不同长度的DNA。在有DNAmarker(不同已知碱基
2
对大小的DNA片段的混淆物)的条件下,由于不同碱基大小的DNA片段在琼脂糖凝胶上涌动
的速度不同,因此电泳完成后会出现在胶块的不同地点。经过将扩增出的DNA片段与已知的
条带做比较,能够大体推断出该片段的碱基对的大小。如果要进一步检测其大小,能够换另
外规格的DNAmarker持续电泳。核酸荧光染料能够与DNA嵌合,一同电泳,DNA图谱察看
仪能够激发特定的蓝色光源,荧光染料在该光照射下可见到荧光,荧光的亮度与DNA大小成正比。
三、实验仪器及试剂
7种PCR组分微量可调移液器离心管PCR仪水平电泳槽电泳仪电源紫外分光光度计250ml锥形瓶(封口膜)记号笔卫生纸
四、实验步骤
1、DNA体外扩增
(1)将所有试剂管刹时离心一次(4000r/min,1min),使管壁没有残留药品,在引物I和引物II的离心管内用移液器各加入40ul双蒸水(ddH2O),混匀后刹时离心一次。所有的离心管都摆到双面板上。
向装有TaqDNA聚合酶的离心管按下表加入以下成分:
10xBuffer
50
μL
MgCl2
50
μL
dNTPmixture
20μL
上游引物(引物I)
25μL
下游引物(引物II)
25
μL
模板DNA
25
μL
ddHO
290μL
2
原有的TaqDNA聚合酶有15ul,此时混淆液体系合计500ul,
此步骤由第一、二组同学
合作达成。(在实验老师的监察指导下操作,保证今后其他同学的实验顺利进行)
(3)共分25组,第一、二组的同学并入其他小组进行实验。每组取
20ul的上述混淆液
于的离心管中,加入15ul
的液体石蜡关闭体系,以防备在加热过程中蒸发。
(4)对自己组的离心管上进行标记之后,放到
PCR仪上进行DNA扩增。
2、琼脂糖凝胶电泳检测
DNA
(1)用蒸馏水将电泳槽和梳子冲刷洁净,放在水平桌面上,并架好梳子。
(2)配制浓度为1%(1g/100mL)的琼脂糖凝胶2块。在锥形瓶中,称取1g的琼脂糖粉,加入100ml1x电泳缓冲液,用封口膜封住瓶口后在微波炉内加热,使琼脂糖粉熔化,
3
然后冷却至60℃,倒入电泳槽中(每块胶50ml),插好梳子,待其凝结。(电泳槽首先用透明胶带将两头封住再进行倒胶)
(3)待胶凝结后,去掉胶带纸,小心移去梳子,注意不要损坏加样孔。将倒胶槽至于
水平电泳槽内,梳井(点样孔)一端朝负极方向。向
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