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第三章
核 酸 技 术 ;核酸的分离和纯化
核酸电泳
染色体DNA电泳
DNA限制酶切反应和限制酶谱绘制
DNA的连接
PCR技术
分子杂交技术
核酸序列的测定
;第一节
核酸的分离和纯化;; 2、载体DNA分离
载体DNA
感染或转染细胞(病毒型) 转化细菌细胞(质粒型)
分离病毒颗粒 培养转化细胞、收集菌体
病毒载体DNA分离与纯化 破碎细胞
质粒DNA分离与纯化
3、DNA片段的分离
DNA 限制酶切 凝胶电泳分离 特定DNA片段的回收; 4、质量评估
1)?凝胶电泳
2)光密度值测定
3)限制酶切分析
二、细胞裂解
1.?酶法:
利用某些细胞壁裂解酶使细胞变为原生质体,然后加去垢剂使原生质体裂解。
1) 细菌:溶菌酶
2) 酵母:蜗牛酶、Novozyme234、glusulase、zymolase 等
3)?丝状真菌:Novozyme234、溶壁酶、纤维素酶
4)?植物细胞:纤维素酶、半纤维素酶、果胶酶
酶法裂解时要注意细胞的生长条件和生长时间,反应时尽可能满足酶的最佳反应条件。; 2.?机械法
1)?压力剪切法:French压力机,酵母细胞,细菌(芽孢和G+球菌除外)
2)射击破碎法:Braun破碎机,搅切器(blender),混合器(玻璃球
3)固体研磨法:将待破碎细胞与玻璃球(0.1~0.45mm)同时致冷,在未融熔前用研杵磨成粉末
4)反复冻融法
三、DNA的分离与纯化
1、供体DNA的分离与纯化
要求:尽可能地保持其高分子量,无其它污染物。
1)??? 基因组大小:;; 1)??? DNA分离纯化过程
破碎细胞 + DNA抽提液(EDTA、去污剂、还原剂) 65℃温育
20’ 冰浴冷却 离心去细胞碎片 苯酚抽提法①
CsCl密度梯度离心②
1) 苯酚抽提法
上清液 缓冲液用水饱和苯酚抽提2~3次 上层液相用氯仿抽至界面无蛋白变性物 上层液相???两倍体积冷乙醇沉淀 沉淀物用70%冷乙醇洗涤,干燥 溶于缓冲液 加入RNAase处理除去RNA 苯酚氯仿抽提 沉淀干燥 ; 2) CsCl密度梯度离心
上清液 加入固体CsCl与EtBr溶液 室温下超速离心(45,000rpm)16小时 穿孔取出DNA(320nm) 异丙醇抽提溴乙锭 缓冲液透析除去残余CsCl 两倍体积冷乙醇沉淀DNA 离心、洗涤、干燥
*两种方法比较:
CsCl法操作步骤少,分离DNA分子量大,耗财多,且需超速离心机。
苯酚法耗时少,不需昂贵仪器,但操作步骤多,易使DNA分子断裂。 若 小心操作,所获DNA亦符合要求。
** 上述两种分离方法都包含了下述四个分离步骤
ⅰ.可溶与不可溶物分离:高速离心除去细胞碎片,保留上清液。
ⅱ. 使蛋白质分离:苯酚抽提或超速离心
ⅲ. 使RNA分离:RNase处理或超速离心
ⅳ. 使DNA与其它可溶物分离; 2.?载体DNA的分离与纯化
1)?质粒载体DNA的分离
关键:如何使质粒DNA与宿主染色体DNA分开
原理:质粒DNA比染色体DNA 小得多,在DNA抽提过程中,染色体DNA断裂成小片段(线状),质粒DNA仍保持超螺旋构型 ; 方法:
ⅰ. 超速离心:利用两种DN
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