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香蕉果实RNA的提取
一、试剂
.十水合硼酸钠,分子量mw38L4。Sigma生产,北京欣经科生物技术公司代理。
.乙二醇双(2—氨基乙基)四乙酸(EGTA),分子量380.4。Sigma生产,北京鼎国生 物技术公司代理。
.二筑基苏糖醇(DTT),分子量154.2, Genview分装,北京鼎国生物技术公司代理。
.脱氧胆酸钠(Sodium Dexycholate),分子量414.56,北京欣经科生物技术公司代理。
. PVP—40,分子量40。Amresco生产,北京欣经科生物技术公司代理。
. Nonidet P—40, Fluka分装,北京欣经科生物技术公司代理。
.氯化锂(Lithum Chloride)分子量42.39, Amresco分装,上海生工代理。
.三羟甲基氨基甲烷(Tris),分子量121. 1。Amresco生产,上海吉泰科技有限公司代 理。
.十二烷基磺酸钠(SDS), sigma生产,舒伯伟化工仪器有限公司代理。
.乙二胺四乙酸二钠盐(EDTA—Naz),分析纯天津化学试剂三厂韦斯实验用品公司代理。
.醋酸钾(KAC),分子量98.14,无水乙醇,分析纯,北京化工厂生产。
.蛋白酶K, 100mg/瓶,Merck生产,北京鼎国生物技术公司代理。
二、配制试剂
RNA提取缓冲液:
200nlM 十水合硼酸钠、30mM EGTA、1%SDS、lOmMDTT、1 %脱氧胆酸钠、2PVP —40、 0.5%NP-40o
0. IM Tris-HCL (pH 7.5)称取L2gTris碱,加入80ml RNase -free水,用浓盐酸调pH达到7. 5。
0. 5mol/L EDTA (pH 8.0)称取 18. 61g EDTA-Na ? 2H20,加入 80ml RNase-free 水和 2. 0g 左右的固体 NaOH,放 在磁力搅拌器上搅拌至固体完全溶解后,用NaOH溶液将pH值准确调整8. 0。用RNase — free水定容到100ml。
IM DTT称取L54g DTT,溶解于10ml 0. 01M pH5. 2NaAc,过滤除菌分装,贮存于一20℃。
600mmol/L KAc (pH 5. 5)
称取5. 89g KAc,溶于30ml RNase-free水中,然后加入2. 0ml冰醋酸,调pH到达 5.5,定容到 100ml。
300mM/L EGTA称取5. 7g EGTA,然后用NaOH颗粒调节pH值到达8.0。
蛋白酶K配成浓度往瓶中加入10ml DEPC处理的水,混匀,4℃保存。
75%的乙醇:配制100ml,用100ml量筒量无水乙醇75ml,加灭菌过的DEPC水定容至 100mL再装入RNA专用的试剂瓶中,4c保存。
三、耗材
.不同规格的试剂瓶、烧杯、量筒、滴管。
. 50ml离心管、1.5ml离心管。
. 一次性过滤器,孔径0.22阿、0.45网,201nl注射器。
.研钵、匀浆器、勺子、镒子、液氮。
四、仪器设备
.离心机:型号5810R, Eppendorf产品,德国。
.恒温水浴摇床
.天平
.超静工作台 五、提取方法
.称取2克香蕉果实(果皮:果肉=1: 1)速冻于液氮中,在研钵中研成粉末。
.将RNA提取缓冲液在80C温浴10分钟。待研钵复温,样品粉末略显潮湿时,加入10ml RNA提取缓冲液,匀浆2分钟。
.匀浆液转移到含5mg (10mg/ml)的蛋白酶K的40nli离心管中。
4,将离心管放在42℃, lOOrpm的恒温水浴摇床温浴1.5小时,不时混匀。
.加入1. 1ml 1. 6M KCL,并且冰浴1小时。
.然后12, OOOrpm, 4℃离心20分钟。
.上清液转移到注射器内,通过一次性过滤器(孔径0. 45MM),过滤到一新的50nli离心 管中。
.加入11ml 4M LiCL,混匀,0℃沉淀过夜。
. 12, OOOrpm, 4℃离心 20 分钟。
.倒掉上清,沉淀用5ml 2MLicL洗二次,直到上清相对无色。
.将沉淀悬浮于2ml lOmM Tris-Hcl (pH 7.5)溶液中,将沉淀重悬。
. 12, OOOrpm, 4℃离心10分钟,转移上清至另一新管。
.加入 1ml 600mM KAc (pH 5.5),冰浴放置 15 分钟。
. 12, OOOrpm, 4C离心。分钟,将上清转移到一新的离心管中。
.上清液加入7. 5ml无水乙醇,混匀,一20℃沉淀过夜。
.用70%预冷乙醇洗涤沉淀一次,空气干燥。
.溶解于ION DEPC处理的水中,37℃助溶5分钟。
说明:本操作中所有器具均用0.1% DEPC水处理并烘干,所有试剂均用DEPC处理水配制, 整个操作过程中要经常更换一次性手套,严格防止RNase的污染。
参考文献Ch
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