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蛋白质;催化作用;二. 蛋白质的化学组成;二. 蛋白质的化学组成;
4.2 蛋白质的基本结构单位 氨基酸
;组成蛋白质的氨基酸都为a-氨基酸(除Pro外);;;I 非极性氨基酸;I 非极性氨基酸;I 非极性氨基酸; 一. 氨基酸的结构;II 非解离的极性氨基酸;II 非解离的极性氨基酸;III 酸性氨基酸;IV 碱性氨基酸; 二. 氨基酸的分类; 二. 氨基酸的分类; 1. 稀有的蛋白质氨基酸 ;以游离或结合态存在于细胞或组织中,大部分是常见氨基酸的衍生物或异构型。
如存在于细菌细胞壁肽聚糖内的D-谷氨酸和D-丙氨酸、花生中的g-亚甲基谷氨酸、甘蔗中的b-氨基丁酸,刀豆中的刀豆氨酸等。 ; 2. 非蛋白质氨基酸;1. 两性性质和等电点 ;1. 两性性质和等电点 ;1. 两性性质和等电点 ;1. 两性性质和等电点 ;1. 两性性质和等电点 ;1. 两性性质和等电点 ;1. 两性性质和等电点 ;1. 两性性质和等电点 ;1. 两性性质和等电点 ;2. 光学性质;2. 光学性质;3. 重要的化学性质;3. 重要的化学性质;3. 重要的化学性质;3. 重要的化学性质;3. 重要的化学性质;3. 重要的化学性质;
4.3 肽(peptide)
; 一. 肽的定义; ; 二.肽的结构; ;?1、中文表示法:
从肽链的N端开始,对氨基酸残基逐一命名,残基称氨酰?;四. 肽的酸碱性质;五. 重要肽;五. 重要肽;
蛋白质的分子结构
;一级结构; 蛋白质的一级结构(primary structure)是指蛋白质肽链中氨基酸的排列顺序。而蛋白质的化学结构包括肽链数目、端基组成、氨基酸序列和二硫键的位置,又称共价结构。蛋白质的一级结构是最基本的结构,它决定着蛋白质高级结构。; 一. 蛋白质的一级结构; 蛋白质的二级结构指多肽链本身通过氢键沿一定方向盘绕、折叠而形成的构象。 ; 蛋白质分子的多肽链按一定方式折叠、盘绕或组装成特有的空间结构,亦称高级结构。蛋白质的高级结构即蛋白质的构象问题。; 构象(conformation)是指相同构型的化合物中,与碳原子相连的各原子或取代基团在单键旋转时形成的相对空间排布。
构象的改变不需要共价键的短裂和重新形成。; X-射线衍射技术研究表明,肽键C-N键介于单键和双键之间,具有部分双键性质,不能自由旋转,其中绝大多数都形成刚??的酰胺平面结构。;酰胺平面 —— 由肽键周围的6个原子组成的刚性平面;虽是单键却有双键性质
周边六个原子在同一平面上
前后两个a-carbon在对角(trans); 因此,从理论上讲,蛋白质中的所有Cα- C单键和Cα- N单键都能自由旋转而形成无数变化的构象。
但事实上,一个天然蛋白质多态链在一定条件下只有一种或很少几种构象,而且相当稳定。
主要原因: ;1. 这是因为主链上由1/3具有部分双键性质的C-N键,不能自由旋转。
2. 此外主链上由很多R侧链,其大小及电荷情况各异。
3. 它们在单链旋转时产生空间位阻和静电效应,制约着大量的构象形成。;可将肽链的主链看成是由被Ca隔开的许多平面组成的。;;1. a-螺旋(a-helix) ;1)肽链中的酰胺平面绕Cα相继旋转一定角度形成α-螺旋,并盘绕前进。每隔3.6个氨基酸残基,螺旋上升一圈;每圈间距0.54nm,即每个氨基酸残基沿螺旋中心轴上升0.15nm,旋转100°。;2)螺旋体中所有氨基酸残基侧链都伸向外侧;
肽链上所有的肽键都参与氢键的形成,链中的全部C=O和N-H几乎都平行于螺旋轴,氢键几乎平行于中心轴;
;3)绝大多数天然蛋白质都是右手螺旋。每个氨基酸残基的N-H都与前面第四个残基C=O形成氢键。 ;* R为Gly时,由于Ca上有2个氢,使Ca-C、Ca-N的转动的自由度很大,即刚性很小,所以使螺旋的稳定性大大降低。;2、?-折叠(?-pleated sheet) ;2、??-折叠(?-pleated sheet) ;2、?-折叠(?-pleated sheet) ;2、 ? -折叠(? -pleated sheet) ;2、 ? -折叠(? -pleated sheet) ;3、 ? -转角( ? -turn);;4、无规则卷曲(non-regular coil) ;1. 定义;三.蛋白质的超二级结构;三.蛋白质的超二级结构;3. 结构域 (domain);3. 结构域 (domain);四.蛋白质的三级结构;(二)球状蛋白的三级的结构特怔;(二)球状蛋白的三级的结构特怔;(三)维持三级结构的作用力;(三)维持三级结构的作用力;五.蛋白质的四级结构;五.蛋白质的四级结构;五.蛋白
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