微生物基因组学研究新技术(教学资料).docVIP

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微生物基因组学研究新技术(教学资料) 文档信息 : 文档作为关于“高等教育”中“生物学”的参考范文,为解决如何写好实用应用文、正确编写文案格式、内容素材摘取等相关工作提供支持。正文6110字,doc格式,可编辑。质优实惠,欢迎下载! 目录 TOC \o 1-9 \h \z \u 目录 1 正文 1 文1:微生物基因组学研究新技术 1 1 454技术 2 2 SOLiD技术 4 3 Illumina技术 4 4 展望 5 文2:麻醉药物基因组学研究进展论文 6 一、 概述 8 二、基本概念 9 1.分子生物学基本概念 9 2.基因多态性的命名法: 9 参考文摘引言: 9 原创性声明(模板) 10 文章致谢(模板) 10 正文 微生物基因组学研究新技术(教学资料) 文1:微生物基因组学研究新技术 人类基因组计划是自然科学发展历史上的一项非常伟大工程,从1990年到2002年,美国、英国、法兰西共和国、德意志联邦共和国、日本和我国六个国家的可削减完成了人类基因组30亿个碱基对的测定。目前,自然科学发展到后基因组时代,人类对于测序技术的需求有增无减,尤其是针对不断出现的病原微生物的基因组序列,DNA测序技术在不断地高速发展,新一代的测序仪器也在不断的被研发。ABI公司生产的Prism3730 DNA测序仪可以说是第一代最为先进的DNA测序仪,其针对基因组大小只有6百万碱基对的大肠杆菌病原株,测序成本却达到数百万人民币。目前我国和世界整体的研究的水平还处在一个低水平阶段,目前最常见DNA检测方法已经难以满足发展的需要,所以我们需要提出新的方法来解决目前毛细管阵列的时间耗用长、经济成本高、普及使用率较低的一系列问题,提高生物基因技术和生物学的快速发展。所以,随着研究人员的研究的不断深入,新的研究方法被我们挖掘出来,新一代的研究方法可以满足大批量生产的需要,普及使用率高,它就是新一代的DNA桑格法检测技术。 DNA新一代的检测技术主要分成两大类:合成测序技术和DNA单分子测序技术。合成测序法主要有454技术、SOLiD技术和Illumina技术,这些技术已经成熟并被广泛应用于微生物组学研究,尤其是基因组学研究。单分子测序法主要包括纳米孔测序等方法,这些技术更为超前但还不成熟,仍在不断改进之中。本文就目前已经成熟的454技术、SOLiD技术和Illumina技术进行综述。 1 454技术 基于焦磷酸测序法,454公司于2005年底推出了革命性的的超高通量基因组测序系统――Genome Sequencer 20 System(454 GS FLX系统),该测序系统的推出以里程碑事件被《Nature》杂志报道,开创了边合成边测序(sequencing-by-synthesis)的测序方法的先河。该系统的流程原理简单来说,就是:“一个片段 = 一个磁珠 = 一条读长(One fragment = One bead = One read)”。目前,由于其具有读长长、易于拼接的特点,被广泛应用于微生物基因组测序中的从头测序研究,大部分新细菌物种的测序都由该技术完成。 454具体流程原理如下:第一:首先把需要检测的样品输入器皿,并且将DNA打成一个一个小的片段,将它打成300到800个大小均等的片段。其次,通过目前的生物学技术并且利用多种标准分子的,制备文库样品,把具有特殊功能的分别接触到DNA片段上,选取特异性的时候,我们要进行编码,分别是3和5,这样就构成了一个简单的样品文库,构成一个以A、b 为两头的单链的DNA片段。第三步,我们就可以对第二步完成的DNA单链进行检测固定,并且利用一个磁珠大约等于一个片段的DNA,充分利用这个手段,将DNA捕获磁珠将单链的DNA固定,接着把单个固定在磁珠上的单链的DNA进行乳化,此时我们通过扩增试剂来对样品进行乳化,让样品形成我们需要的油包水的混合物,并且把含有一个单链的DNA放在一个反应器里面,使得每一个都可以独立的完成扩增。 (5)一个磁珠=一条读长:在PTP板中放入携带DNA片段的捕获磁珠,然后将PTP板放置在454 GS FLX系统中,开始测序。将四种碱基按照T、A、C、G的顺序依次循环进入PTP板。如果有碱基配对的发生,这时会释放出一个焦磷酸。经过ATP硫酸化酶催化的合成反应和萤光素酶催化的化学发光反应,焦磷酸将萤光素氧化成氧化萤光素,同时释放出光信号。释放的光信号可被仪器携带的高灵敏度CCD实时捕获到。每有一个碱基和测序模板进行配对,高灵敏度CCD就会捕获到一分子的光信号,并一一对应,从而准确、快速地确定待测模板的碱基序列。这也就是焦磷酸测序。(6)数据分析:GS FLX 系统提供两种不同的生物信息学工具分析所获得的

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