基因表达及功能分析的基本策略.pptVIP

第二节 生物信息学在预测基因 功能中的应用 Bioinformatics Application in Predicting Gene Function 第二十九页，共七十九页，2022年，8月28日 一、利用生物信息学方法进行基因功能注释 (一）通过序列比对预测基因功能 序列比对是生物信息学最基本的分析技术之一，最常用的方法是将目的DNA或蛋白质序列与已知的DNA和蛋白质序列数据库进行比对，搜索到与目的序列高度同源的功能已知的基因或蛋白质，用这些基因和蛋白质预测目的基因和蛋白质的功能。局部比对搜索工具BLAST是进行序列比对的基本工具，它允许用户选择一条查询序列与一个数据库进行比对，找到数据库中与输入的查询序列相匹配的项。BLAST是一个序列数据库搜索程序家族，其中包括许多有特定用途的程序。 第三十页，共七十九页，2022年，8月28日 程序 查询序列类型 数据库类型 注 BLASTN DNA DNA BLASTP 蛋白质 蛋白质 BLASTX DNA 蛋白质 将待搜索的核酸序列按6个阅读框翻译成蛋白质序列，然后与数据库中的蛋白质序列比对 TBLASTN 蛋白质 DNA 将数据库中的核酸序列按6个阅读框翻译成蛋白质序列，然后与待搜索的蛋白质序列比对 TBLASTX DNA DNA 无论是待搜索的核酸序列还是数据库中的核酸序列都按6个阅读框翻译成蛋白质序列