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基因表达的调节基因表达调节的基本概念及原理原核;基因表达调节的基本概念及原理
原核生物基因转录调节
真核生物基因转录调节;第 一 节基本概念与原理;;典型的基因表达是储存遗传信息的基因,在一定调节机制控制下,经过转录、翻译,产生有生物活性的蛋白质或成熟的rRNA和tRNA的过程。; 大肠杆菌基因组(约4000个基因),一般情况下只有5-10%在高水平转录状态,其它基因有的处于较低水平的表达,或者暂时不表达。
人的基因组约含有10万个基因,但在一个组织细胞中通常只有一部分基因表达,多数基因处在沉静状态,典型的哺乳类细胞中开放转录的基因约在1万个上下,即使蛋白质合成量比较多、基因开放比例较高的肝细胞,一般也只有不超过20%的基因处于表达状态。 ;二、基因表达的规律
--时间性及空间性;(2)空间特异性;三、基因表达的方式;无论表达水平高低,管家基因较少受环境因素影响,而是在个体各个生长阶段的大多数或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。区别于其他基因,这类基因表达被视为组成性基因表达。
组成性基因表达只受到启动序列或者启动子与RNA聚合酶相互作用的影响。;(2)诱导和阻遏表达; 是指在特定环境因素刺激下,可诱导基因被激活,从而使基因的表达产物增加。
如:DNA发生损伤时,修复酶的基因被诱导激活。 ;如果基因对环境信号应答是被抑制,这种基因是可阻遏基因。;在一定机制控制下,功能上相关的一组基因,无论其为何种表达方式,均需协调一致、共同表达,即为协调表达(coordinate expression),这种调节称为协调调节(coordinate regulation)。;1、基因表达的多级调控;2、特异DNA序列对基因转录激活的调节;原核生物; RNA聚合酶结合并启动转录的特异DNA序列。;真核生物;顺式作用元件通常是基因的非编码序列。
不同真核生物的顺式作用元件中也会发现一些共有序列 ,如TATA盒、CAAT盒等,这些共有序列是RNA聚合酶或特异转录因子的结合位点。;3、调节蛋白对转录起始的调节;热休克反应;当操纵序列结合有阻遏蛋白时,会阻碍RNA聚合酶与启动序列的结合,或是RNA聚合酶不能沿DNA向前移动 ,阻碍转录。;激活蛋白可结合启动序列邻近的DNA序列,促进RNA聚合酶与启动序列的结合,增强RNA聚合酶活性。;有些基因在没有激活蛋白存在时,RNA聚合酶很少或完全不能结合启动序列。;真核基因的调节蛋白--反式作用因子(转录因子);转录调节因子结构;(1)调节蛋白与DNA的结合;螺旋-转角-螺旋(HTH);锌指(zinc finger)
见于TFⅢA和类固醇激素受体中,由一段富含半胱氨酸的多肽链构成。每四个半胱氨酸残基或His残基螯合一分子Zn2+,其余约12-13个残基则呈指样突出,刚好能嵌入DNA双螺旋的大沟中而与之相结合。每个蛋白质分子中可含2-9个锌指结构。 ;常结合DNA的GC盒,也有与mRNA结合的功能。;同质异形结构域;(2)调节蛋白中
蛋白质-蛋白质相互作用结构域;二聚体
亮氨酸之间相互作用形成二聚体,形成“拉链” 。
肽链氨基端20~30个富含碱性氨基酸结构域与DNA结合。;亮氨酸拉链;碱性螺旋-环-螺旋(HLH);4、RNA聚合酶;⑴ 启动序列与RNA聚合酶活性 ;⑵ 调节蛋白与RNA聚合酶活性;第 二 节 原核生物基因转录调节;——调节的主要环节在转录起始;二、乳糖操纵子调节机制;;;CAP—降解物基因活化蛋白 CAP-cAMP复合物; 调节基因转录翻译阻遏蛋白R,R与操纵基因结合,阻止结合在启动子上的RNA-pol前移,结构基因不被转录 。; 由于葡萄糖降解物能降低cAMP含量,不与CAP形成复合物, CAP不能结合到启动子附近,RNA聚合酶不能有效转录,使细菌只能利用葡萄糖。; 细胞内cAMP含量高,cAMP与CAP结合成复合物,与DNA结合,并推动RNA-pol向前移动,促进转录。 ;(4)协调调节;三、其它转录调节机制;第51页/共76页; AraC蛋白通过两种异构体( P1和P2 )来实现正、负调节因子的双重功能。
在没有阿拉伯糖时,P1形式占优势,可以与现在尚未鉴定的类操纵区位点相结合, 起阻遏作用。
一旦有阿拉伯糖存在,它就能够与AraC蛋白结合,使P1离开操纵基因位点,构象平衡趋向于P2形式。 P2是起诱导作用的形式,它通过与启动子结合促进RNA-pol开始转录,发挥正向调节作用。;2、色氨酸操纵子的转录弱化调节;;阻遏-操纵机制是一级开关,主管转录是否启动,相当于粗调开关。
前导序列翻译前导肽是二级开关
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